RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478272.1

TMTC4-208, Transcript of transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 4, human

TSL 2

Gene TMTC4, Length 798 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMTC4-208	ENST00000478272	NUP98	P52948	1817 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	RFC4	P35249	363 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	ANXA1	P04083	346 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	GYS1	P13807	737 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	GPR162	Q16538	588 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	PROSER3	Q2NL68	480 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	WDR63	Q8IWG1	891 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	TSPYL6	Q8N831	410 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		12.02	□□□□□ -0.48
TMTC4-208	ENST00000478272	MYL6B	P14649	208 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	NGEF	Q8N5V2	710 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	PDIA6	Q15084	440 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	ARX	Q96QS3	562 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		12	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		12	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	ZPR1	O75312	459 aa		12	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	CAMTA2	O94983	1202 aa		12	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		12	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		12	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		12	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	NARF	Q9UHQ1	456 aa		12	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		12	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272		A0A087WZG4	1122 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	MMP10	P09238	476 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	HOXB7	P09629	217 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	POLD1	P28340	1107 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	POTEH	Q6S545	545 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	DDR1	Q08345	913 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	GOLGA2	Q08379	1002 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	NFIX	Q14938	502 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	SLFN5	Q08AF3	891 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	HLF	Q16534	295 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TMTC4-208	ENST00000478272	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272		E9PSI1	815 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	CACNA1S	Q13698	1873 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	GRIN3B	O60391	1043 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	VAMP4	O75379	141 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	TM4SF1	P30408	202 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	ATP10D	Q9P241	1426 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	SERPINB2	P05120	415 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	GPT	P24298	496 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	G2E3	Q7L622	706 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TMTC4-208	ENST00000478272	HYPK	Q9NX55	129 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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