RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
ACTB-209ENST00000473257 NBPF26B4DH59 902 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 POTEIP0CG38 1075 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 POTEJP0CG39 1038 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 ERFEQ4G0M1 354 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 NBPF15Q8N660 670 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 CFAP53Q96M91 514 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 SRGNP10124 158 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 JMYQ8N9B5 988 aa15□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 BCORQ6W2J9 1755 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 CAPN15O75808 1086 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 ST5P78524 1137 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 HLFQ16534 295 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 SLC51AQ86UW1 340 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 NGEFQ8N5V2 710 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 STYK1Q6J9G0 422 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 NUDCQ9Y266 331 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 CNKSR1Q969H4 720 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 MASTLQ96GX5 879 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-209ENST00000473257 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 ABCC12Q96J65 1359 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 CHADLQ6NUI6 762 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 MYL6BP14649 208 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 NPR1P16066 1061 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 CCDC93Q567U6 631 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 GPTP24298 496 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 TNS4Q8IZW8 715 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-209ENST00000473257 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.032e-6■■□□□ 13.5
ACTB-209ENST00000473257 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 SOGA3Q5TF21 947 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 SYNE4Q8N205 404 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 COL4A5P29400 1685 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 ZNF428Q96B54 188 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 ANXA1P04083 346 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 NFE2L2Q16236 605 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 SUSD4Q5VX71 490 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 CREBZFQ9NS37 354 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 NUP98P52948 1817 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.031e-47■□□□□ 8.3
ACTB-209ENST00000473257 PROSER3Q2NL68 480 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 LDHDQ86WU2 507 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 NECTIN2Q92692 538 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 PASKQ96RG2 1323 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 SNED1Q8TER0 1413 aa14.83□□□□□ -0.03
ACTB-209ENST00000473257 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 EPHX2P34913 555 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 CRY2Q49AN0 593 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-209ENST00000473257 HACL1Q9UJ83 578 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms