RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469744.1

MRPL28-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MRPL28, Length 1,467 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28-208ENST00000469744 NGEFQ8N5V2 710 aa22.92■■□□□ 1.26
MRPL28-208ENST00000469744 ADCY9O60503 1353 aa22.91■■□□□ 1.26
MRPL28-208ENST00000469744 SETDB2Q96T68 719 aa22.91■■□□□ 1.26
MRPL28-208ENST00000469744 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.9■■□□□ 1.26
MRPL28-208ENST00000469744 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
MRPL28-208ENST00000469744 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.9■■□□□ 1.26
MRPL28-208ENST00000469744 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
MRPL28-208ENST00000469744 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.89■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 MYL6BP14649 208 aa22.88■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 NPHP1O15259 732 aa22.87■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 CNBD1Q8NA66 436 aa22.87■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.87■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
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MRPL28-208ENST00000469744 H0YIN7 160 aa22.85■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.85■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.85■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.85■■□□□ 1.25
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MRPL28-208ENST00000469744 FAM177BA6PVY3 158 aa22.84■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 KRT24Q2M2I5 525 aa22.84■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 CACNA1SQ13698 1873 aa22.84■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 APAF1O14727 1248 aa22.83■■□□□ 1.25
MRPL28-208ENST00000469744 NECTIN2Q92692 538 aa22.83■■□□□ 1.25
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MRPL28-208ENST00000469744 ST5P78524 1137 aa22.82■■□□□ 1.24
MRPL28-208ENST00000469744 TTLL6Q8N841 843 aa22.82■■□□□ 1.24
MRPL28-208ENST00000469744 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
MRPL28-208ENST00000469744 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
MRPL28-208ENST00000469744 CHL1O00533 1208 aa22.81■■□□□ 1.24
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MRPL28-208ENST00000469744 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.81■■□□□ 1.24
MRPL28-208ENST00000469744 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.81■■□□□ 1.24
MRPL28-208ENST00000469744 SBF1O95248 1867 aa22.81■■□□□ 1.24
MRPL28-208ENST00000469744 PROSER3Q2NL68 480 aa22.8■■□□□ 1.24
MRPL28-208ENST00000469744 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.8■■□□□ 1.24
MRPL28-208ENST00000469744 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.8■■□□□ 1.24
MRPL28-208ENST00000469744 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.79■■□□□ 1.24
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MRPL28-208ENST00000469744 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
MRPL28-208ENST00000469744 ERBB4Q15303 1308 aa22.78■■□□□ 1.24
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MRPL28-208ENST00000469744 GPTP24298 496 aa22.78■■□□□ 1.24
MRPL28-208ENST00000469744 C1QTNF8P60827 252 aa22.78■■□□□ 1.24
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MRPL28-208ENST00000469744 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.74■■□□□ 1.23
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MRPL28-208ENST00000469744 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.73■■□□□ 1.23
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MRPL28-208ENST00000469744 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.71■■□□□ 1.23
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MRPL28-208ENST00000469744 SUSD4Q5VX71 490 aa22.7■■□□□ 1.22
MRPL28-208ENST00000469744 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.7■■□□□ 1.22
MRPL28-208ENST00000469744 CNKSR1Q969H4 720 aa22.7■■□□□ 1.22
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MRPL28-208ENST00000469744 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.69■■□□□ 1.22
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MRPL28-208ENST00000469744 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.69■■□□□ 1.22
MRPL28-208ENST00000469744 IFT57Q9NWB7 429 aa22.69■■□□□ 1.22
MRPL28-208ENST00000469744 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
MRPL28-208ENST00000469744 KIF3CO14782 793 aa22.68■■□□□ 1.22
MRPL28-208ENST00000469744 NPR1P16066 1061 aa22.68■■□□□ 1.22
MRPL28-208ENST00000469744 LMNB1P20700 586 aa22.68■■□□□ 1.22
MRPL28-208ENST00000469744 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
MRPL28-208ENST00000469744 NTSR2O95665 410 aa22.66■■□□□ 1.22
MRPL28-208ENST00000469744 GNAI1P63096 354 aa22.66■■□□□ 1.22
MRPL28-208ENST00000469744 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
MRPL28-208ENST00000469744 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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