RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468247.1

RERE-210, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 2

Gene RERE, Length 414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-210ENST00000468247 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.59■■■□□ 2.01
RERE-210ENST00000468247 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.59■■■□□ 2.01
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RERE-210ENST00000468247 NEUROD2Q15784 382 aa27.58■■■□□ 2.01
RERE-210ENST00000468247 SBF1O95248 1867 aa27.57■■■□□ 2
RERE-210ENST00000468247 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
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RERE-210ENST00000468247 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
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RERE-210ENST00000468247 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.49■■□□□ 1.99
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RERE-210ENST00000468247 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
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RERE-210ENST00000468247 GLTPD2A6NH11 291 aa27.37■■□□□ 1.97
RERE-210ENST00000468247 NTSR2O95665 410 aa27.37■■□□□ 1.97
RERE-210ENST00000468247 COPS6Q7L5N1 327 aa27.37■■□□□ 1.97
RERE-210ENST00000468247 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.37■■□□□ 1.97
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RERE-210ENST00000468247 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.33■■□□□ 1.97
RERE-210ENST00000468247 CCDC93Q567U6 631 aa27.33■■□□□ 1.97
RERE-210ENST00000468247 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
RERE-210ENST00000468247 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.32■■□□□ 1.96
RERE-210ENST00000468247 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
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RERE-210ENST00000468247 SLC51AQ86UW1 340 aa27.31■■□□□ 1.96
RERE-210ENST00000468247 POTECB2RU33 542 aa27.3■■□□□ 1.96
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