RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 SPG7Q9UQ90 795 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 COL15A1P39059 1388 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.06□□□□□ -1.28
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PTPRC-210ENST00000462363 GNAI2P04899 355 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 GNAI3P08754 354 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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PTPRC-210ENST00000462363 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 RREB1Q92766 1687 aa7.06□□□□□ -1.28
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PTPRC-210ENST00000462363 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 DNAAF4Q8WXU2 420 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 STAP2Q9UGK3 403 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 PHLPP1O60346 1717 aa7.04□□□□□ -1.28
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PTPRC-210ENST00000462363 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 AK9Q5TCS8 1911 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 PI4KAP2A4QPH2 592 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 HMMRO75330 724 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 ALDH1L1O75891 902 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 ANXA1P04083 346 aa7.04□□□□□ -1.28
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PTPRC-210ENST00000462363 KSR2Q6VAB6 950 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 NECTIN2Q92692 538 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 KAZALD1Q96I82 304 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 KIF2CQ99661 725 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 OCEL1Q9H607 264 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.04□□□□□ -1.28
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PTPRC-210ENST00000462363 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-210ENST00000462363 DOT1LQ8TEK3 1739 aa7.03□□□□□ -1.28
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PTPRC-210ENST00000462363 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
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PTPRC-210ENST00000462363 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 CDC45O75419 566 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRC-210ENST00000462363 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 IL2RBP14784 551 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 SDSP20132 328 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 DDIT3P35638 169 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRC-210ENST00000462363 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
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PTPRC-210ENST00000462363 RAB11FIP3O75154 756 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 SLC4A3P48751 1232 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 SNX21Q969T3 373 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 MARVELD3Q96A59 401 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 FMNL2Q96PY5 1086 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 LRRCC1Q9C099 1032 aa7□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-210ENST00000462363 GRM8O00222 908 aa6.99□□□□□ -1.29
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