RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 KRT24Q2M2I5 525 aa26.53■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 GRIN3BO60391 1043 aa26.52■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.52■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.52■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.52■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 STK31Q9BXU1 1019 aa26.52■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
IMP4-209ENST00000462357 C4AP0C0L4 1744 aa26.51■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 ST5P78524 1137 aa26.51■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.51■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 PDIA6Q15084 440 aa26.5■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 COPS6Q7L5N1 327 aa26.5■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 CNBD1Q8NA66 436 aa26.5■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.5■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.49■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 NYXQ9GZU5 481 aa26.49■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 PDE6BP35913 854 aa26.48■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.48■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.48■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.47■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.46■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.46■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.46■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.46■■□□□ 1.83
IMP4-209ENST00000462357 E9PSI1 815 aa26.45■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 H0YIN7 160 aa26.45■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 HLFQ16534 295 aa26.45■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 PARP10Q53GL7 1025 aa26.45■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.45■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 PIM2Q9P1W9 311 aa26.45■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 A0A0G2JLW4 131 aa26.44■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 ANXA1P04083 346 aa26.44■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 PROSER3Q2NL68 480 aa26.44■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.44■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.43■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 DPEP1P16444 411 aa26.42■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.42■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.41■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 TSPYL6Q8N831 410 aa26.41■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 ZNF521Q96K83 1311 aa26.39■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 ATP10DQ9P241 1426 aa26.39■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 TCIRG1Q13488 830 aa26.39■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.39■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.39■■□□□ 1.82
IMP4-209ENST00000462357 SCN7AQ01118 1682 aa26.38■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 FAM177BA6PVY3 158 aa26.38■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 GPTP24298 496 aa26.38■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 BCS1LQ9Y276 419 aa26.38■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 SLC4A2P04920 1241 aa26.37■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.37■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 VAMP4O75379 141 aa26.36■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.36■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 CHRNA5P30532 468 aa26.34■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 TTLL6Q8N841 843 aa26.34■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 SLFN5Q08AF3 891 aa26.33■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.33■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 CNKSR1Q969H4 720 aa26.33■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 ZNF428Q96B54 188 aa26.33■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
IMP4-209ENST00000462357 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.82e-12■■□□□ 12
IMP4-209ENST00000462357 KCNA3P22001 575 aa26.32■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 SUSD4Q5VX71 490 aa26.32■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 MASTLQ96GX5 879 aa26.32■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 BCORQ6W2J9 1755 aa26.32■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 STYK1Q6J9G0 422 aa26.31■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 KSR2Q6VAB6 950 aa26.31■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.31■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 NLRP10Q86W26 655 aa26.3■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.3■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 NLRP3Q96P20 1036 aa26.3■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 NPR1P16066 1061 aa26.29■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 ALDH1B1P30837 517 aa26.29■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.29■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 SRGNP10124 158 aa26.28■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.28■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.28■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.28■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 YY1P25490 414 aa26.27■■□□□ 1.8
IMP4-209ENST00000462357 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
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