RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 MPSTP25325 297 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 IFT43Q96FT9 208 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 MSX1P28360 303 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGAP4P98171 946 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 IER5Q5VY09 327 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 CITED4Q96RK1 184 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 F11P03951 625 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP4AP20648 1035 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 ECM1Q16610 540 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 PGBD3Q8N328 593 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 KLK14Q9P0G3 267 aa9.68□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFB5O43674 189 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 AAMPQ13685 434 aa9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 SUSD3Q96L08 255 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM47Q96LD4 638 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 ZIC5Q96T25 663 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 PCSK2P16519 638 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 MAPK1P28482 360 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 NLRP8Q86W28 1048 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 RGS22Q8NE09 1264 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 DACH1Q9UI36 760 aa9.65□□□□□ -0.86
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A1W2PNR3 127 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 ZAP70P43403 619 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 USP5P45974 858 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 EFHC2Q5JST6 749 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 TREML1Q86YW5 311 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 MICAL2O94851 1124 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 Q6ZNB5 142 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 ASB16Q96NS5 453 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 H7C1W4 665 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 PTSQ03393 145 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 PDE3BQ13370 1112 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 GMCL1Q96IK5 515 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 GPAMQ9HCL2 828 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 BCS1LQ9Y276 419 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC35F4A4IF30 521 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB39O15060 712 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 FZD6O60353 706 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 EPB42P16452 691 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 ARSDP51689 593 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 COL19A1Q14993 1142 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 TTC16Q8NEE8 873 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 RUBCNLQ9H714 662 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 IDH3AP50213 366 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 EHHADHQ08426 723 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM26DQ5JW98 314 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-205ENST00000462042 SOBPA7XYQ1 873 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 PDGFAP04085 211 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 INPP5BP32019 993 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 ATCAYQ86WG3 371 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 TMC1Q8TDI8 760 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 EDEM1Q92611 657 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP63Q96MT8 703 aa9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 OPLAHO14841 1288 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 TYRO3Q06418 890 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 GJD3Q8N144 294 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR152Q8TDT2 470 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 POLIQ9UNA4 740 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM157BP0CG42 384 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms