RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 H0YIN7 160 aa36.21■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 CHL1O00533 1208 aa36.21■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 HLFQ16534 295 aa36.21■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 KIF6Q6ZMV9 814 aa36.21■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 MRS2Q9HD23 443 aa36.21■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 ST5P78524 1137 aa36.2■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 TTLL7Q6ZT98 887 aa36.2■■■■□ 3.39
FAAP20-210ENST00000440825 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa36.19■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 KRT24Q2M2I5 525 aa36.19■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa36.18■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 BRIP1Q9BX63 1249 aa36.18■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 ATP10DQ9P241 1426 aa36.17■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 PDE6BP35913 854 aa36.17■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 ZBTB3Q9H5J0 574 aa36.17■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa36.17■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 ERBB4Q15303 1308 aa36.16■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 ANXA1P04083 346 aa36.16■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP36.16■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa36.15■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 TTLL6Q8N841 843 aa36.15■■■■□ 3.38
FAAP20-210ENST00000440825 DLEC1Q9Y238 1755 aa36.13■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 CFAP44Q96MT7 982 aa36.13■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 ERVV-1B6SEH8 477 aa36.12■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 PROSER3Q2NL68 480 aa36.12■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 RGL2O15211 777 aa36.11■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 PDIA6Q15084 440 aa36.1■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 TPTE2Q6XPS3 522 aa36.1■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 MBIPQ9NS73 344 aa36.1■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 ADCY9O60503 1353 aa36.1■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 GPTP24298 496 aa36.09■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa36.09■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 NUP98P52948 1817 aa36.08■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
FAAP20-210ENST00000440825 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa36.06■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 IFT57Q9NWB7 429 aa36.06■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 GNAI1P63096 354 aa36.05■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 C9orf131Q5VYM1 1079 aa36.05■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 LRP10Q7Z4F1 713 aa36.04■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 CHPF2Q9P2E5 772 aa36.04■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF853P0CG23 659 aa36.03■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 RASSF7Q02833 373 aa36.03■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 DUSP27Q5VZP5 1158 aa36.03■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 COPS6Q7L5N1 327 aa36.03■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 XAGE3Q8WTP9 111 aa36.03■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 NUTM1Q86Y26 1132 aa36.02■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 NYXQ9GZU5 481 aa36.02■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP36.02■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 RNF181Q9P0P0 153 aa36.02■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 SRGNP10124 158 aa36.01■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 MASTLQ96GX5 879 aa36.01■■■■□ 3.36
FAAP20-210ENST00000440825 CACNA1SQ13698 1873 aa36■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 UBN2Q6ZU65 1347 aa36■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 C21orf2O43822 256 aa35.99■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 HOXB7P09629 217 aa35.99■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 STYK1Q6J9G0 422 aa35.99■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 CNKSR1Q969H4 720 aa35.99■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 ERFEQ4G0M1 354 aa35.97■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 SUSD4Q5VX71 490 aa35.97■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF34Q8IZ26 560 aa35.97■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 ABCC12Q96J65 1359 aa35.95■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 FAM9BQ8IZU0 186 aa35.95■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
FAAP20-210ENST00000440825 NPR1P16066 1061 aa35.94■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa35.93■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 C1QTNF8P60827 252 aa35.92■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 WWC1Q8IX03 1113 aa35.92■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 SLX4Q8IY92 1834 aa35.92■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 PARP10Q53GL7 1025 aa35.91■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 SBF1O95248 1867 aa35.9■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 NFKBIEO00221 500 aa35.9■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 NTSR2O95665 410 aa35.9■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC27Q2M243 656 aa35.9■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 C8orf58Q8NAV2 365 aa35.9■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 LMNB1P20700 586 aa35.89■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa35.89■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 HYPKQ9NX55 129 aa35.89■■■■□ 3.34
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF428Q96B54 188 aa35.88■■■■□ 3.33
FAAP20-210ENST00000440825 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
FAAP20-210ENST00000440825 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
FAAP20-210ENST00000440825 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa35.87■■■■□ 3.33
FAAP20-210ENST00000440825 PRELPP51888 382 aa35.86■■■■□ 3.33
FAAP20-210ENST00000440825 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa35.86■■■■□ 3.33
FAAP20-210ENST00000440825 TCIRG1Q13488 830 aa35.85■■■■□ 3.33
FAAP20-210ENST00000440825 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa35.85■■■■□ 3.33
FAAP20-210ENST00000440825 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
FAAP20-210ENST00000440825 PLBD2Q8NHP8 589 aa35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms