RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439929.1

RPS29P3-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P3, Length 171 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P3-201ENST00000439929 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.65□□□□□ -0.54
RPS29P3-201ENST00000439929 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RPS29P3-201ENST00000439929 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.65□□□□□ -0.54
RPS29P3-201ENST00000439929 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RPS29P3-201ENST00000439929 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.64□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 ZPR1O75312 459 aa11.64□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 TM4SF1P30408 202 aa11.64□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 NFIXQ14938 502 aa11.64□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 BICDL1Q6ZP65 573 aa11.64□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 KLHL34Q8N239 644 aa11.64□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.64□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.63□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.63□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 ZNF428Q96B54 188 aa11.63□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.63□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 ERBB4Q15303 1308 aa11.62□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 TAF1P21675 1872 aa11.62□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 HOXB7P09629 217 aa11.62□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 POLD1P28340 1107 aa11.62□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 SLFN5Q08AF3 891 aa11.62□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 G2E3Q7L622 706 aa11.62□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.62□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa11.61□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.61□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 A0A087WZG4 1122 aa11.61□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 VAMP4O75379 141 aa11.61□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 GOLGA2Q08379 1002 aa11.61□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 COPS6Q7L5N1 327 aa11.61□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 SYT17Q9BSW7 474 aa11.61□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.61□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 ATP10DQ9P241 1426 aa11.6□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 COL4A1P02462 1669 aa11.6□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.6□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 ABCC12Q96J65 1359 aa11.59□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 FAM177BA6PVY3 158 aa11.59□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 GPTP24298 496 aa11.59□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 MYH16Q9H6N6 1097 aa11.59□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.59□□□□□ -0.55
RPS29P3-201ENST00000439929 ADCY9O60503 1353 aa11.58□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 E9PSI1 815 aa11.58□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 SERPINB2P05120 415 aa11.58□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.58□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.58□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 SPEF2Q9C093 1822 aa11.58□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.57□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.57□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 SLX4Q8IY92 1834 aa11.57□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 MYH3P11055 1940 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 A0A0G2JLW4 131 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 CHRNA5P30532 468 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 CCDC30Q5VVM6 783 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 CLEC4GQ6UXB4 293 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 SYNE4Q8N205 404 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 HYPKQ9NX55 129 aa11.56□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.55□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.55□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 SLC4A2P04920 1241 aa11.55□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.55□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 KCNA3P22001 575 aa11.55□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 SUSD4Q5VX71 490 aa11.55□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 SLC51AQ86UW1 340 aa11.55□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 SETDB2Q96T68 719 aa11.55□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 BCL2L13Q9BXK5 485 aa11.55□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.55□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.55□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 NTSR2O95665 410 aa11.54□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 DPEP1P16444 411 aa11.54□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 ERFEQ4G0M1 354 aa11.54□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.54□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.54□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.54□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 ZNF652Q9Y2D9 606 aa11.54□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 CHD4Q14839 1912 aa11.54□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 FLIIQ13045 1269 aa11.53□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 TCIRG1Q13488 830 aa11.53□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 NLRP10Q86W26 655 aa11.53□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 CNBD1Q8NA66 436 aa11.53□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 SSH1Q8WYL5 1049 aa11.53□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 STK31Q9BXU1 1019 aa11.53□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.53□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 SBF1O95248 1867 aa11.53□□□□□ -0.56
RPS29P3-201ENST00000439929 PI4KAP2A4QPH2 592 aa11.52□□□□□ -0.57
RPS29P3-201ENST00000439929 F6X3S4 739 aa11.52□□□□□ -0.57
RPS29P3-201ENST00000439929 RGL2O15211 777 aa11.52□□□□□ -0.57
RPS29P3-201ENST00000439929 IGKV5-2P06315 115 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms