RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.17■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.16■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.16■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHL1O00533 1208 aa21.14■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.13■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.13■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.13■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.13■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TTLL6Q8N841 843 aa21.13■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.13■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CFAP44Q96MT7 982 aa21.13■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM177BA6PVY3 158 aa21.12■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NECTIN2Q92692 538 aa21.12■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.12■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP10DQ9P241 1426 aa21.12■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.11■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GNAI1P63096 354 aa21.11■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HLFQ16534 295 aa21.11■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC184Q52MB2 194 aa21.11■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.1■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NYXQ9GZU5 481 aa21.1■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.09■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IFT57Q9NWB7 429 aa21.09■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.09■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UTRNP46939 3433 aa21.09■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HOXB7P09629 217 aa21.08■□□□□ 0.97
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRT24Q2M2I5 525 aa21.07■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CNKSR1Q969H4 720 aa21.07■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MBIPQ9NS73 344 aa21.07■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADCY9O60503 1353 aa21.07■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANXA1P04083 346 aa21.06■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPTP24298 496 aa21.06■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MASTLQ96GX5 879 aa21.06■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.06■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDIA6Q15084 440 aa21.05■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.05■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.05■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STYK1Q6J9G0 422 aa21.05■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SRGNP10124 158 aa21.04■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PROSER3Q2NL68 480 aa21.04■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.04■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COPS6Q7L5N1 327 aa21.04■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNF181Q9P0P0 153 aa21.04■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.04■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.03■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.03■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.03■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUP98P52948 1817 aa21.03■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.02■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF853P0CG23 659 aa21.02■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NPR1P16066 1061 aa21.02■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PARP10Q53GL7 1025 aa21.02■□□□□ 0.96
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C21orf2O43822 256 aa21.01■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC27Q2M243 656 aa21.01■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SOGA3Q5TF21 947 aa21.01■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.01■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.01■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RASSF7Q02833 373 aa21■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF34Q8IZ26 560 aa21■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM9BQ8IZU0 186 aa21■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HYPKQ9NX55 129 aa21■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UBN2Q6ZU65 1347 aa21■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LMNB1P20700 586 aa20.99■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ERFEQ4G0M1 354 aa20.99■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SUSD4Q5VX71 490 aa20.99■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ALDH1B1P30837 517 aa20.98■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C1QTNF8P60827 252 aa20.98■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WWC1Q8IX03 1113 aa20.98■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABCC12Q96J65 1359 aa20.97■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GOLGA2Q08379 1002 aa20.96■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.96■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.96■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.96■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CACNA1SQ13698 1873 aa20.96■□□□□ 0.95
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NTSR2O95665 410 aa20.95■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCIRG1Q13488 830 aa20.95■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC93Q567U6 631 aa20.95■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.95■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NLRP3Q96P20 1036 aa20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms