RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421827.2

UBXN11-208, Transcript of UBX domain protein 11, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN11, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11-208ENST00000421827 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
UBXN11-208ENST00000421827 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.59■■□□□ 1.37
UBXN11-208ENST00000421827 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.58■■□□□ 1.37
UBXN11-208ENST00000421827 PDE6BP35913 854 aa23.58■■□□□ 1.37
UBXN11-208ENST00000421827 ST5P78524 1137 aa23.58■■□□□ 1.37
UBXN11-208ENST00000421827 HLFQ16534 295 aa23.58■■□□□ 1.37
UBXN11-208ENST00000421827 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
UBXN11-208ENST00000421827 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.58■■□□□ 1.37
UBXN11-208ENST00000421827 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
UBXN11-208ENST00000421827 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.58■■□□□ 1.37
UBXN11-208ENST00000421827 ADCY9O60503 1353 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 CFAP44Q96MT7 982 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 ATP10DQ9P241 1426 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 TTLL6Q8N841 843 aa23.56■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 PDIA6Q15084 440 aa23.55■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 MRS2Q9HD23 443 aa23.55■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.55■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 KRT24Q2M2I5 525 aa23.54■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.54■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.54■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 NECTIN2Q92692 538 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 ZNF853P0CG23 659 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 PROSER3Q2NL68 480 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 MBIPQ9NS73 344 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN11-208ENST00000421827 FAM177BA6PVY3 158 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 ANXA1P04083 346 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 HOXB7P09629 217 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 IFT57Q9NWB7 429 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 GNAI1P63096 354 aa23.5■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 NUP98P52948 1817 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 SRGNP10124 158 aa23.48■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.48■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.48■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 STYK1Q6J9G0 422 aa23.48■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 NYXQ9GZU5 481 aa23.48■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 GPTP24298 496 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 CNKSR1Q969H4 720 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 MASTLQ96GX5 879 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 COPS6Q7L5N1 327 aa23.46■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.46■■□□□ 1.35
UBXN11-208ENST00000421827 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.45■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 CCDC27Q2M243 656 aa23.45■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.45■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 NPR1P16066 1061 aa23.44■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 RASSF7Q02833 373 aa23.44■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 RNF181Q9P0P0 153 aa23.44■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 C21orf2O43822 256 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 SUSD4Q5VX71 490 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 C1QTNF8P60827 252 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 ERFEQ4G0M1 354 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 PARP10Q53GL7 1025 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 ABCC12Q96J65 1359 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 WWC1Q8IX03 1113 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 NFKBIEO00221 500 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 NTSR2O95665 410 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 LMNB1P20700 586 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 HYPKQ9NX55 129 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 SBF1O95248 1867 aa23.4■■□□□ 1.34
UBXN11-208ENST00000421827 SLX4Q8IY92 1834 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.39■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 TCIRG1Q13488 830 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 SOGA3Q5TF21 947 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.38■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 ALDH1B1P30837 517 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 PRELPP51888 382 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 CRY2Q49AN0 593 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.37■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.36■■□□□ 1.33
UBXN11-208ENST00000421827 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.36■■□□□ 1.33
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