RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PROSER3Q2NL68 480 aa22.45■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.45■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.45■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.45■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.45■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.45■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCORQ6W2J9 1755 aa22.45■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.44■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANXA1P04083 346 aa22.44■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SERPINB2P05120 415 aa22.44■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.44■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.44■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SETDB2Q96T68 719 aa22.44■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.44■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF521Q96K83 1311 aa22.43■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GOLGA2Q08379 1002 aa22.42■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.42■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TGFB2P61812 414 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HLFQ16534 295 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COPS6Q7L5N1 327 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSPYL6Q8N831 410 aa22.41■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NPHP1O15259 732 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HYPKQ9NX55 129 aa22.4■■□□□ 1.18
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP10DQ9P241 1426 aa22.39■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNBD1Q8NA66 436 aa22.38■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GRIN3BO60391 1043 aa22.37■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.36■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STK31Q9BXU1 1019 aa22.36■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.36■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.36■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 E9PSI1 815 aa22.35■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ST5P78524 1137 aa22.35■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A0G2JLW4 131 aa22.34■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DPEP1P16444 411 aa22.34■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.34■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.34■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPTP24298 496 aa22.33■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.33■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NYXQ9GZU5 481 aa22.33■■□□□ 1.17
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM177BA6PVY3 158 aa22.32■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.32■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.32■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.32■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.32■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.31■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VAMP4O75379 141 aa22.31■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDE6BP35913 854 aa22.31■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PARP10Q53GL7 1025 aa22.31■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHRNA5P30532 468 aa22.3■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.3■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.3■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.29■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLFN5Q08AF3 891 aa22.29■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TCIRG1Q13488 830 aa22.29■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.29■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.29■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.29■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIM2Q9P1W9 311 aa22.29■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEP350Q5VT06 3117 aa22.29■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADCY9O60503 1353 aa22.28■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H0YIN7 160 aa22.28■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC4A2P04920 1241 aa22.28■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNA3P22001 575 aa22.28■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SUSD4Q5VX71 490 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCS1LQ9Y276 419 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.26■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUP98P52948 1817 aa22.26■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NTSR2O95665 410 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERFEQ4G0M1 354 aa22.24■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NLRP10Q86W26 655 aa22.24■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCC12Q96J65 1359 aa22.24■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FLIIQ13045 1269 aa22.23■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KSR2Q6VAB6 950 aa22.22■■□□□ 1.15
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 G2E3Q7L622 706 aa22.22■■□□□ 1.15
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