RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409958.6

VSX1-204, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VSX1, Length 1,305 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-204ENST00000409958 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.93■■□□□ 1.9
VSX1-204ENST00000409958 PROSER3Q2NL68 480 aa26.92■■□□□ 1.9
VSX1-204ENST00000409958 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.92■■□□□ 1.9
VSX1-204ENST00000409958 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.92■■□□□ 1.9
VSX1-204ENST00000409958 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.92■■□□□ 1.9
VSX1-204ENST00000409958 WDR63Q8IWG1 891 aa26.92■■□□□ 1.9
VSX1-204ENST00000409958 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
VSX1-204ENST00000409958 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.91■■□□□ 1.9
VSX1-204ENST00000409958 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
VSX1-204ENST00000409958 HLFQ16534 295 aa26.9■■□□□ 1.9
VSX1-204ENST00000409958 UTRNP46939 3433 aa26.9■■□□□ 1.9
VSX1-204ENST00000409958 ANXA1P04083 346 aa26.9■■□□□ 1.9
VSX1-204ENST00000409958 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
VSX1-204ENST00000409958 A0A0G2JLW4 131 aa26.89■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 DPEP1P16444 411 aa26.89■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 YY1P25490 414 aa26.89■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.89■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.88■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 GRIN3BO60391 1043 aa26.87■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.87■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.87■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.87■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 COPS6Q7L5N1 327 aa26.86■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 ATP10DQ9P241 1426 aa26.85■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 KCNA3P22001 575 aa26.85■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 CNBD1Q8NA66 436 aa26.85■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.85■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 NUP98P52948 1817 aa26.84■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 HYPKQ9NX55 129 aa26.84■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 NPHP1O15259 732 aa26.83■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 TSPYL6Q8N831 410 aa26.83■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.83■■□□□ 1.89
VSX1-204ENST00000409958 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.82■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 CHRNA5P30532 468 aa26.82■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 ST5P78524 1137 aa26.82■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 MIER1Q8N108 512 aa26.82■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 PIM2Q9P1W9 311 aa26.82■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 ZNF521Q96K83 1311 aa26.82■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.81■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.81■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.8■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.8■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 PDE6BP35913 854 aa26.79■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.79■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 BCS1LQ9Y276 419 aa26.79■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 GOLGA2Q08379 1002 aa26.78■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.78■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.78■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 NYXQ9GZU5 481 aa26.78■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.78■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.78■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 H0YIN7 160 aa26.77■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 GPTP24298 496 aa26.77■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.77■■□□□ 1.88
VSX1-204ENST00000409958 CHD4Q14839 1912 aa26.76■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 FAM177BA6PVY3 158 aa26.76■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 PARP10Q53GL7 1025 aa26.76■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.76■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.76■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.74■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 TCIRG1Q13488 830 aa26.73■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 SUSD4Q5VX71 490 aa26.73■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.73■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 STK31Q9BXU1 1019 aa26.72■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 TTLL6Q8N841 843 aa26.71■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.71■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 VAMP4O75379 141 aa26.7■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 NTSR2O95665 410 aa26.7■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.7■■□□□ 1.87
VSX1-204ENST00000409958 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.7■■□□□ 1.86
VSX1-204ENST00000409958 SRGNP10124 158 aa26.69■■□□□ 1.86
VSX1-204ENST00000409958 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
VSX1-204ENST00000409958 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
VSX1-204ENST00000409958 ERFEQ4G0M1 354 aa26.68■■□□□ 1.86
VSX1-204ENST00000409958 STYK1Q6J9G0 422 aa26.68■■□□□ 1.86
VSX1-204ENST00000409958 NLRP10Q86W26 655 aa26.68■■□□□ 1.86
VSX1-204ENST00000409958 MASTLQ96GX5 879 aa26.68■■□□□ 1.86
VSX1-204ENST00000409958 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
VSX1-204ENST00000409958 ABCC12Q96J65 1359 aa26.68■■□□□ 1.86
VSX1-204ENST00000409958 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.68■■□□□ 1.86
VSX1-204ENST00000409958 E9PSI1 815 aa26.67■■□□□ 1.86
VSX1-204ENST00000409958 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
VSX1-204ENST00000409958 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms