RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395560.7

UPP1-202, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 955 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-202ENST00000395560 PLIN1O60240 522 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 TRIM27P14373 513 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 ADRA2BP18089 450 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 YY1P25490 414 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 COL15A1P39059 1388 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 RGL2O15211 777 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 ABCC4O15439 1325 aa22.67■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.67■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 SSFA2P28290 1259 aa22.67■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.67■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 AKT1S1Q96B36 256 aa22.67■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.66■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.66■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.66■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.66■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.66■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.66■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 ADCY9O60503 1353 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-202ENST00000395560 NEFLP07196 543 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 ARXQ96QS3 562 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 MTFR1LQ9H019 292 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.63■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 NARFQ9UHQ1 456 aa22.63■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.63■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 ATP10DQ9P241 1426 aa22.63■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 F6X3S4 739 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 RFC4P35249 363 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 SYT17Q9BSW7 474 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 ZPR1O75312 459 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 CAMTA2O94983 1202 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 LINS1Q8NG48 757 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 PANK1Q8TE04 598 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 TNNQ9UQP3 1299 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 BCORQ6W2J9 1755 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 ALDH1L1O75891 902 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 PHF14O94880 888 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 RLBP1P12271 317 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 TCIRG1Q13488 830 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 BEND3Q5T5X7 828 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.58■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.58■■□□□ 1.21
UPP1-202ENST00000395560 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 C4AP0C0L4 1744 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 NUP98P52948 1817 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 MYD88Q99836 296 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 SCN7AQ01118 1682 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 AAMPQ13685 434 aa22.56■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 HLFQ16534 295 aa22.56■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.56■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 COG6Q9Y2V7 657 aa22.56■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 IGKV5-2P06315 115 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 SMIM5Q71RC9 77 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-202ENST00000395560 CRBNQ96SW2 442 aa22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms