RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDC14CA4D256 554 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 VSIG8P0DPA2 414 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 TATP17735 454 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP2B4P23634 1241 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 LCE1DQ5T752 114 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 SV2AQ7L0J3 742 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 USTQ9Y2C2 406 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A1W2PNR3 127 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 H7C1W4 665 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCNN1AP37088 669 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1orf53Q5VUE5 145 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 CAPN12Q6ZSI9 719 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 PGBD3Q8N328 593 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 GMCL1Q96IK5 515 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 NGLY1Q96IV0 654 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR25O00155 361 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 SSFA2P28290 1259 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 LBRQ14739 615 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 EFHC2Q5JST6 749 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 BICDL1Q6ZP65 573 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 RHPN1Q8TCX5 695 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 MKNK1Q9BUB5 465 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 RTN1Q16799 776 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 NLRP8Q86W28 1048 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 VTI1AQ96AJ9 217 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 HSH2DQ96JZ2 352 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 SAP130Q9H0E3 1048 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 BNIP3LO60238 219 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRT76Q01546 638 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 GAS6Q14393 721 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNFT1Q5M7Z0 435 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF280CQ8ND82 737 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 COL26A1Q96A83 441 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 MYO19Q96H55 970 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 SUSD3Q96L08 255 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 NDFIP2Q9NV92 336 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLK14Q9P0G3 267 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEPT3Q9UH03 358 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 HCN2Q9UL51 889 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRFN2Q9ULH4 789 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 BCS1LQ9Y276 419 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 COX20Q5RI15 118 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 SAMD5Q5TGI4 173 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 GJA3Q9Y6H8 435 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCDC2BA2VCK2 349 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM157BP0CG42 384 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNP2Q05952 138 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 DGKZQ13574 1117 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 C16orf46Q6P387 395 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 FOXR1Q6PIV2 292 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 FIGNL1Q6PIW4 674 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRERF1Q96PN7 1200 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 NEUROD4Q9HD90 331 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNFRSF10BO14763 440 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 EFSO43281 561 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAPTP10636 758 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 TYRO3Q06418 890 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDE4CQ08493 712 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 C11orf91Q3C1V1 193 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM26DQ5JW98 314 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 STRN4Q9NRL3 753 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 TGFBR3LH3BV60 316 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 FGFR3P22607 806 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTBSQ01459 385 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIF1AQ16665 826 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 IER5Q5VY09 327 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 BTLAQ7Z6A9 289 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 IFT43Q96FT9 208 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 CEP63Q96MT8 703 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-227P-201ENST00000362865 MBIPQ9NS73 344 aa4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms