RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 C8orf58Q8NAV2 365 aa35.07■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 HOXB7P09629 217 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 TGFB2P61812 414 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 CLEC4GQ6UXB4 293 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC24Q8N4L8 307 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB3Q9H5J0 574 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 CHPF2Q9P2E5 772 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa35.06■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 CCER2I3L3R5 266 aa35.05■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 SETDB2Q96T68 719 aa35.04■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF652Q9Y2D9 606 aa35.04■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 KCNA3P22001 575 aa35.03■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 CHRNA5P30532 468 aa35.03■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 PRR5LQ6MZQ0 368 aa35.03■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 TSPYL6Q8N831 410 aa35.03■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 IL16Q14005 1332 aa35.03■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 KIF6Q6ZMV9 814 aa35.02■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP35.02■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP35.01■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 ERVV-1B6SEH8 477 aa35■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 RGL2O15211 777 aa35■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 XAGE3Q8WTP9 111 aa35■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 COPS6Q7L5N1 327 aa34.99■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 MIER1Q8N108 512 aa34.99■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 WDR63Q8IWG1 891 aa34.98■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 FANCIQ9NVI1 1328 aa34.97■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 FAM177BA6PVY3 158 aa34.96■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 CNBD1Q8NA66 436 aa34.96■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 ATP10DQ9P241 1426 aa34.96■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 UBN2Q6ZU65 1347 aa34.95■■■■□ 3.19
TPGS1-201ENST00000359315 GPTP24298 496 aa34.94■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF521Q96K83 1311 aa34.93■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 BCS1LQ9Y276 419 aa34.93■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 UTRNP46939 3433 aa34.92■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 NPHP1O15259 732 aa34.9■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 GRIN3BO60391 1043 aa34.9■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 C2CD5Q86YS7 1000 aa34.9■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 BRIP1Q9BX63 1249 aa34.9■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa34.89■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF34Q8IZ26 560 aa34.89■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 PIM2Q9P1W9 311 aa34.89■■■■□ 3.18
TPGS1-201ENST00000359315 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 YY1P25490 414 aa34.88■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 ST5P78524 1137 aa34.88■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 SUSD4Q5VX71 490 aa34.87■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 HYPKQ9NX55 129 aa34.87■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 ABCC12Q96J65 1359 aa34.87■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 NUTM1Q86Y26 1132 aa34.86■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 NUP98P52948 1817 aa34.85■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 TPTE2Q6XPS3 522 aa34.85■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 PDE6BP35913 854 aa34.83■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC30Q5VVM6 783 aa34.83■■■■□ 3.17
TPGS1-201ENST00000359315 H0YIN7 160 aa34.82■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 NTSR2O95665 410 aa34.82■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 PLBD2Q8NHP8 589 aa34.82■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA2Q08379 1002 aa34.81■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 ERFEQ4G0M1 354 aa34.81■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa34.81■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF428Q96B54 188 aa34.81■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 TCIRG1Q13488 830 aa34.8■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 MYH16Q9H6N6 1097 aa34.79■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 DLEC1Q9Y238 1755 aa34.78■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP34.78■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 VAMP4O75379 141 aa34.77■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 SRGNP10124 158 aa34.77■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 PARP10Q53GL7 1025 aa34.77■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa34.77■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 NLRP10Q86W26 655 aa34.77■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 NYXQ9GZU5 481 aa34.77■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 TTLL6Q8N841 843 aa34.76■■■■□ 3.16
TPGS1-201ENST00000359315 G2E3Q7L622 706 aa34.75■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa34.74■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa34.74■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 C3orf67Q6ZVT6 689 aa34.73■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa34.73■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 ISCA1Q9BUE6 129 aa34.73■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 STK31Q9BXU1 1019 aa34.73■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa34.73■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 RIC3Q7Z5B4 369 aa34.72■■■■□ 3.15
TPGS1-201ENST00000359315 SYNE4Q8N205 404 aa34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms