RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 RFC4P35249 363 aa25.98■■□□□ 1.75
RALGPS1-202ENST00000319107 PROSER3Q2NL68 480 aa25.98■■□□□ 1.75
RALGPS1-202ENST00000319107 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
RALGPS1-202ENST00000319107 A0A087WZG4 1122 aa25.97■■□□□ 1.75
RALGPS1-202ENST00000319107 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
RALGPS1-202ENST00000319107 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.97■■□□□ 1.75
RALGPS1-202ENST00000319107 ANXA1P04083 346 aa25.96■■□□□ 1.75
RALGPS1-202ENST00000319107 HSPA6P17066 643 aa25.96■■□□□ 1.75
RALGPS1-202ENST00000319107 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.96■■□□□ 1.75
RALGPS1-202ENST00000319107 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.95■■□□□ 1.75
RALGPS1-202ENST00000319107 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
RALGPS1-202ENST00000319107 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 NUP98P52948 1817 aa25.95■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.94■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF428Q96B54 188 aa25.94■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 STK31Q9BXU1 1019 aa25.94■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 HYPKQ9NX55 129 aa25.93■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 NARFQ9UHQ1 456 aa25.93■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.9■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 ADCY9O60503 1353 aa25.9■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 ZPR1O75312 459 aa25.89■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 CAMTA2O94983 1202 aa25.89■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 MMP10P09238 476 aa25.89■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.89■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.89■■□□□ 1.74
RALGPS1-202ENST00000319107 GYS1P13807 737 aa25.88■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.88■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.88■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.88■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 COPS6Q7L5N1 327 aa25.88■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.88■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 SLC4A2P04920 1241 aa25.87■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 RGL2O15211 777 aa25.86■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.86■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.85■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.84■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.83■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 FLIIQ13045 1269 aa25.83■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 G2E3Q7L622 706 aa25.83■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.83■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.83■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.83■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.83■■□□□ 1.73
RALGPS1-202ENST00000319107 FKBP8Q14318 412 aa25.82■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.82■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.82■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.82■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.81■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 HLFQ16534 295 aa25.8■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.79■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.77■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 KIF16BQ96L93 1317 aa25.77■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.77■■□□□ 1.72
RALGPS1-202ENST00000319107 NFIXQ14938 502 aa25.76■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.76■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 PTPRCP08575 1304 aa25.76■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.75■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 TM4SF1P30408 202 aa25.75■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.75■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 KSR2Q6VAB6 950 aa25.75■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.74■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.74■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 KIF3CO14782 793 aa25.74■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 APLP1P51693 650 aa25.74■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 TGFB2P61812 414 aa25.74■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 DDR1Q08345 913 aa25.74■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.74■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.74■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.73■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.72■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 BCAR3O75815 825 aa25.72■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 TCIRG1Q13488 830 aa25.72■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.72■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.71■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.71■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 SETDB2Q96T68 719 aa25.71■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 LAMB2P55268 1798 aa25.71■■□□□ 1.71
RALGPS1-202ENST00000319107 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.7■■□□□ 1.7
RALGPS1-202ENST00000319107 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.7■■□□□ 1.7
RALGPS1-202ENST00000319107 GPTP24298 496 aa25.69■■□□□ 1.7
RALGPS1-202ENST00000319107 MYD88Q99836 296 aa25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms