RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303731.8

TRAPPC1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC1, Length 811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-201ENST00000303731 TOMM70O94826 608 aa21.93■■□□□ 1.1
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TRAPPC1-201ENST00000303731 STYK1Q6J9G0 422 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC1-201ENST00000303731 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC1-201ENST00000303731 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.92■■□□□ 1.1
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TRAPPC1-201ENST00000303731 NUP98P52948 1817 aa21.87■■□□□ 1.09
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TRAPPC1-201ENST00000303731 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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TRAPPC1-201ENST00000303731 CCDC93Q567U6 631 aa21.79■■□□□ 1.08
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TRAPPC1-201ENST00000303731 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.77■■□□□ 1.08
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TRAPPC1-201ENST00000303731 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 NTSR2O95665 410 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC1-201ENST00000303731 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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TRAPPC1-201ENST00000303731 SUSD4Q5VX71 490 aa21.72■■□□□ 1.07
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