RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 TTLL7Q6ZT98 887 aa32.4■■■□□ 2.78
CXCL2-201ENST00000296031 SETDB2Q96T68 719 aa32.4■■■□□ 2.78
CXCL2-201ENST00000296031 IL16Q14005 1332 aa32.4■■■□□ 2.78
CXCL2-201ENST00000296031 CARMIL3Q8ND23 1372 aa32.4■■■□□ 2.78
CXCL2-201ENST00000296031 LRP10Q7Z4F1 713 aa32.39■■■□□ 2.78
CXCL2-201ENST00000296031 WWC3Q9ULE0 1092 aa32.39■■■□□ 2.78
CXCL2-201ENST00000296031 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 WDR63Q8IWG1 891 aa32.38■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa32.37■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 A0A0G2JLW4 131 aa32.37■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 ERVV-1B6SEH8 477 aa32.37■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 HLFQ16534 295 aa32.37■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 NUP98P52948 1817 aa32.37■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP32.36■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 C8orf58Q8NAV2 365 aa32.36■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP32.36■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 DPEP1P16444 411 aa32.35■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB3Q9H5J0 574 aa32.35■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 CHPF2Q9P2E5 772 aa32.35■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP32.34■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
CXCL2-201ENST00000296031 NPHP1O15259 732 aa32.32■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 PRR5LQ6MZQ0 368 aa32.31■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 COPS6Q7L5N1 327 aa32.31■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 MIER1Q8N108 512 aa32.31■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC24Q8N4L8 307 aa32.3■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 CNBD1Q8NA66 436 aa32.3■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 XAGE3Q8WTP9 111 aa32.3■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 CHRNA5P30532 468 aa32.29■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa32.29■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 UTRNP46939 3433 aa32.29■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 GRIN3BO60391 1043 aa32.28■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 KCNA3P22001 575 aa32.28■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 TSPYL6Q8N831 410 aa32.28■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 CHMP4AQ9BY43 222 aa32.28■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 FANCIQ9NVI1 1328 aa32.27■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 ATP10DQ9P241 1426 aa32.27■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 FAM177BA6PVY3 158 aa32.27■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 CHD4Q14839 1912 aa32.27■■■□□ 2.76
CXCL2-201ENST00000296031 ST5P78524 1137 aa32.26■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 HYPKQ9NX55 129 aa32.26■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 BRIP1Q9BX63 1249 aa32.25■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 BCS1LQ9Y276 419 aa32.25■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 GPTP24298 496 aa32.24■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 TPTE2Q6XPS3 522 aa32.24■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 PIM2Q9P1W9 311 aa32.24■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 DLEC1Q9Y238 1755 aa32.23■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 GOLGA2Q08379 1002 aa32.23■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 CCDC30Q5VVM6 783 aa32.23■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF521Q96K83 1311 aa32.23■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 C2CD5Q86YS7 1000 aa32.22■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF34Q8IZ26 560 aa32.22■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 MYH16Q9H6N6 1097 aa32.22■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa32.22■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 PDE6BP35913 854 aa32.21■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 UBN2Q6ZU65 1347 aa32.21■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 H0YIN7 160 aa32.2■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 YY1P25490 414 aa32.2■■■□□ 2.75
CXCL2-201ENST00000296031 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa32.19■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa32.19■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 PLBD2Q8NHP8 589 aa32.18■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 NYXQ9GZU5 481 aa32.18■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa32.18■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa32.17■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 TCIRG1Q13488 830 aa32.15■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 PARP10Q53GL7 1025 aa32.15■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 SUSD4Q5VX71 490 aa32.15■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 STK31Q9BXU1 1019 aa32.15■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa32.14■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 NUTM1Q86Y26 1132 aa32.14■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
CXCL2-201ENST00000296031 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa32.13■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP32.13■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 ABCC12Q96J65 1359 aa32.12■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 VAMP4O75379 141 aa32.12■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 ERFEQ4G0M1 354 aa32.12■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 NTSR2O95665 410 aa32.11■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 TTLL6Q8N841 843 aa32.11■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 RIC3Q7Z5B4 369 aa32.1■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 CACNA1SQ13698 1873 aa32.1■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 SRGNP10124 158 aa32.09■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 NLRP10Q86W26 655 aa32.09■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
CXCL2-201ENST00000296031 E9PSI1 815 aa32.08■■■□□ 2.73
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