RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295314.8

TMOD4-201, Transcript of tropomodulin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD4, Length 1,267 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4-201ENST00000295314 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TMOD4-201ENST00000295314 IFT57Q9NWB7 429 aa15.46■□□□□ 0.07
TMOD4-201ENST00000295314 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
TMOD4-201ENST00000295314 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 HOXB7P09629 217 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 HLFQ16534 295 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 C2CD5Q86YS7 1000 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF853P0CG23 659 aa15.44■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.44■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 TTLL6Q8N841 843 aa15.44■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 PDIA6Q15084 440 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 CCDC27Q2M243 656 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 NECTIN2Q92692 538 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 NYXQ9GZU5 481 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 MBIPQ9NS73 344 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 SCN7AQ01118 1682 aa15.42■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 KRT24Q2M2I5 525 aa15.42■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.42■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.42■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.42■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.42■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 CHD4Q14839 1912 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 FAM177BA6PVY3 158 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 COPS6Q7L5N1 327 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 PROSER3Q2NL68 480 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 WWC1Q8IX03 1113 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 CNKSR1Q969H4 720 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD4-201ENST00000295314 ANXA1P04083 346 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 STYK1Q6J9G0 422 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 MASTLQ96GX5 879 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 HYPKQ9NX55 129 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 ATP10DQ9P241 1426 aa15.38■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 SRGNP10124 158 aa15.38■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 GPTP24298 496 aa15.38■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 PARP10Q53GL7 1025 aa15.38■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.38■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.38■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 BCORQ6W2J9 1755 aa15.37■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 NPR1P16066 1061 aa15.37■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 IL16Q14005 1332 aa15.37■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 ALDH1B1P30837 517 aa15.36■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.36■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.35■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 TCIRG1Q13488 830 aa15.35■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 SOGA3Q5TF21 947 aa15.35■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 SUSD4Q5VX71 490 aa15.35■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 C9orf131Q5VYM1 1079 aa15.35■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 WDR63Q8IWG1 891 aa15.35■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 C8orf58Q8NAV2 365 aa15.35■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.35■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 ADCY9O60503 1353 aa15.35■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 C21orf2O43822 256 aa15.34■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 ERFEQ4G0M1 354 aa15.34■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 CCDC30Q5VVM6 783 aa15.34■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 NUTM1Q86Y26 1132 aa15.34■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.34■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TMOD4-201ENST00000295314 LMNB1P20700 586 aa15.33■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 RNF181Q9P0P0 153 aa15.33■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.33■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 NTSR2O95665 410 aa15.32■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 NLRP3Q96P20 1036 aa15.32■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 GOLGA2Q08379 1002 aa15.31■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 CRY2Q49AN0 593 aa15.31■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.31■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.31■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 NLRP10Q86W26 655 aa15.31■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
TMOD4-201ENST00000295314 RASSF7Q02833 373 aa15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms