RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC171Q6TFL3 1326 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 USO1O60763 962 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SEC24BO95487 1268 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 KIF14Q15058 1648 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.33□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 DNAAF4Q8WXU2 420 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ZBTB9Q96C00 473 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CUL7Q14999 1698 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 FLIIQ13045 1269 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SNX21Q969T3 373 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 NAPBQ9H115 298 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 HS1BP3Q53T59 392 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 DACT1Q9NYF0 836 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 NEK1Q96PY6 1258 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 DNAI1Q9UI46 699 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 YEATS4O95619 227 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 POTEB2H3BUK9 544 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 USP5P45974 858 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.32□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 STRN4Q9NRL3 753 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 NESP48681 1621 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CAPN2P17655 700 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 NECAB1Q8N987 351 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 IQGAP2Q13576 1575 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 FAM83GA6ND36 823 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 IVLP07476 585 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.31□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ABCC5O15440 1437 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MYZAPP0CAP1 466 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 LIG1P18858 919 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 METTL24Q5JXM2 366 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 RSPH14Q9UHP6 348 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC175P0C221 793 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 VPS36Q86VN1 386 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MBIPQ9NS73 344 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MEIS3Q99687 375 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 IQCA1Q86XH1 822 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 GOLIM4O00461 696 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SYT1P21579 422 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ALS2CR12Q96Q35 445 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC102BQ68D86 513 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 MICU3Q86XE3 530 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 ECHDC1Q9NTX5 307 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 UBE4AQ14139 1066 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SMC5Q8IY18 1101 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 TCEANC2Q96MN5 208 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 PTGS1P23219 599 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 PDE1AP54750 535 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SBNO1-201ENST00000267176 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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