RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 PHF14O94880 888 aa23.57■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 KSR2Q6VAB6 950 aa23.57■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 C4BP0C0L5 1744 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.56■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 HLFQ16534 295 aa23.55■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 ILDR2Q71H61 639 aa23.55■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.55■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.55■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 RREB1Q92766 1687 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.54■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF827Q17R98 1081 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 MYD88Q99836 296 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 AK7Q96M32 723 aa23.53■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.52■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.52■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PRRT1-201ENST00000211413 RPS6KA4O75676 772 aa23.51■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 BEND3Q5T5X7 828 aa23.51■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 COL15A1P39059 1388 aa23.51■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 IGKV5-2P06315 115 aa23.51■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.51■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.49■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.49■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 MEIS3Q99687 375 aa23.49■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 MS4A1P11836 297 aa23.49■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 BAG6P46379 1132 aa23.49■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.49■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 GPTP24298 496 aa23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 CAMTA2O94983 1202 aa23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 NUP98P52948 1817 aa23.47■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.45■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 AKT1S1Q96B36 256 aa23.45■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.45■■□□□ 1.35
PRRT1-201ENST00000211413 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.45■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.44■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.44■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 USP44Q9H0E7 712 aa23.44■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.44■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 FAM177BA6PVY3 158 aa23.43■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.43■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 LINS1Q8NG48 757 aa23.43■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.43■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 C4AP0C0L4 1744 aa23.43■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 TCIRG1Q13488 830 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.42■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 RFC4P35249 363 aa23.41■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 SYNE4Q8N205 404 aa23.41■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.41■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 ATP10DQ9P241 1426 aa23.4■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 BCL11AQ9H165 835 aa23.4■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.4■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.39■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 GCKRQ14397 625 aa23.39■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.39■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 NARFQ9UHQ1 456 aa23.39■■□□□ 1.34
PRRT1-201ENST00000211413 ZPR1O75312 459 aa23.39■■□□□ 1.33
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.38■■□□□ 1.33
PRRT1-201ENST00000211413 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PRRT1-201ENST00000211413 BCORQ6W2J9 1755 aa23.37■■□□□ 1.33
PRRT1-201ENST00000211413 A0A087WZG4 1122 aa23.37■■□□□ 1.33
PRRT1-201ENST00000211413 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.37■■□□□ 1.33
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC125Q86Z20 511 aa23.37■■□□□ 1.33
PRRT1-201ENST00000211413 ALDH1L1O75891 902 aa23.37■■□□□ 1.33
PRRT1-201ENST00000211413 SLC15A2Q16348 729 aa23.37■■□□□ 1.33
PRRT1-201ENST00000211413 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.37■■□□□ 1.33
PRRT1-201ENST00000211413 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PRRT1-201ENST00000211413 SSFA2P28290 1259 aa23.36■■□□□ 1.33
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