RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zbtb45Q52KG4 520 aa27.11■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cchcr1Q8K2I2 770 aa27.11■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ush1cQ9ES64 910 aa27.11■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa27.11■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 E4f1Q8CCE9 783 aa27.11■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Col15a1O35206 1367 aa27.1■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pdzd9Q9D9M4 266 aa27.1■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dzip1Q8BMD2 852 aa27.1■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q9D9S1 216 aa27.1■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf692Q3U381 531 aa27.09■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Clcn1Q64347 994 aa27.09■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 1700006A11RikB9EHI3 544 aa27.08■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa27.08■■□□□ 1.93
Ubp1-204ENSMUST00000214095 F2rP30558 430 aa27.07■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Casc1Q6TDU8 730 aa27.07■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sgsm2Q80U12 1005 aa27.07■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ets1P27577 440 aa27.06■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TkfcQ8VC30 578 aa27.06■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cdca7lQ922M5 438 aa27.06■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa27.05■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kcnb2A6H8H5 907 aa27.05■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Becn1O88597 448 aa27.05■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc26a8Q8R0C3 999 aa27.05■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa27.05■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Chd1lQ9CXF7 900 aa27.05■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa27.05■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ak2Q9WTP6 239 aa27.05■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tpm2P58774 284 aa27.05■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pank2Q3U4S0 443 aa27.04■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ube2hP62257 183 aa27.04■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 DpydQ8CHR6 1025 aa27.04■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 ThemisQ8BGW0 636 aa27.03■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppm1mQ8BU27 406 aa27.03■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Igfbp6P47880 238 aa27.02■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Chmp7Q8R1T1 451 aa27.02■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ddx60E9PZQ1 1711 aa27.02■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Iqsec3Q3TES0 1195 aa27.02■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dmrt2Q8BG36 561 aa27.02■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfml1Q8BSH2 233 aa27.02■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc178Q8CDV0 866 aa27.02■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Naa30Q8CES0 364 aa27.02■■□□□ 1.92
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ubxn10Q8BG34 277 aa27.01■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Samm50Q8BGH2 469 aa27.01■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 OptnQ8K3K8 584 aa27.01■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Med4Q9CQA5 270 aa27.01■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 EappQ5BU09 281 aa27.01■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa27.01■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp48Q3V0C5 1052 aa27■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pcmtd1P59913 357 aa27■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Phkg2Q9DB30 406 aa27■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sytl4Q9R0Q1 673 aa27■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 SnrkQ8VDU5 748 aa26.99■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam184aE9PW83 1143 aa26.99■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MecomP14404 1042 aa26.99■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa26.99■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc173A0JLY1 547 aa26.98■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slain2Q8CI08 581 aa26.98■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TefQ9JLC6 301 aa26.98■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cnnm1Q0GA42 951 aa26.97■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nlrp9bQ66X22 1003 aa26.97■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zscan22Q8BGS5 496 aa26.97■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Farp2Q91VS8 1065 aa26.97■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Polr3dQ91WD1 398 aa26.97■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Babam1Q3UI43 333 aa26.96■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Morc2aQ69ZX6 1030 aa26.96■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rhot2Q8JZN7 620 aa26.96■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttll7A4Q9F0 912 aa26.96■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ugt1a5B2RT14 529 aa26.96■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mdm2P23804 489 aa26.96■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CrklP47941 303 aa26.96■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pnma3Q8JZW8 466 aa26.95■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atf7Q8R0S1 413 aa26.95■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Erbb4Q61527 1308 aa26.95■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Anp32cQ64G17 123 aa26.95■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prkab2Q6PAM0 271 aa26.95■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dixdc1Q80Y83 711 aa26.94■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Shank2Q80Z38 1476 aa26.94■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21698A0A087WQP8 267 aa26.94■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21671G3UY31 267 aa26.94■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 GnpatP98192 678 aa26.94■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp51Q3U4L8 781 aa26.94■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mindy4Q3UQI9 744 aa26.94■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gzf1Q4VBD9 706 aa26.94■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kcna6Q61923 529 aa26.94■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Eef2kO08796 724 aa26.93■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnf20Q5DTM8 973 aa26.93■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hspa2P17156 633 aa26.93■■□□□ 1.9
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Jarid2Q62315 1234 aa26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.3 ms