RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mmp8O70138 465 aa35.77■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dpf1Q9QX66 387 aa35.77■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfyve9A2A8R0 1397 aa35.77■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam213aQ9CYH2 218 aa35.76■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ank1Q02357 1862 aa35.76■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NmiO35309 314 aa35.76■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q8BT18 775 aa35.76■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hoxa7P02830 229 aa35.75■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 VgfQ0VGU4 617 aa35.75■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slf2Q6P9P0 1278 aa35.74■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gcc1Q9D4H2 778 aa35.73■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 C4bP01029 1738 aa35.73■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nlrp9bQ66X22 1003 aa35.72■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smc4Q8CG47 1286 aa35.72■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm38655A0A286YDK6 273 aa35.72■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 B4galnt3Q6L8S8 986 aa35.72■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arap2Q8BZ05 1703 aa35.72■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pim2Q62070 370 aa35.71■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SowahdQ8BY98 327 aa35.71■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dbr1Q923B1 550 aa35.71■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mcmdc2E9Q956 681 aa35.7■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc27Q3V036 639 aa35.7■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tgfb1i1Q62219 461 aa35.7■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lama4P97927 1816 aa35.7■■■■□ 3.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Snapc4Q8BP86 1333 aa35.69■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 InsrrQ9WTL4 1300 aa35.69■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mcm2P97310 904 aa35.69■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Map7O88735 730 aa35.68■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NexnQ7TPW1 607 aa35.68■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trim34aQ99PP6 485 aa35.68■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa35.67■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Casz1Q9CWL2 1761 aa35.66■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slfnl1Q8BHW9 410 aa35.65■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Strn4P58404 760 aa35.64■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Snai1Q02085 264 aa35.64■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GpkowQ56A08 488 aa35.64■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trip6Q9Z1Y4 480 aa35.64■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa35.64■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 FanclQ9CR14 375 aa35.64■■■■□ 3.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp1b3P97370 278 aa35.62■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adam1aQ60813 791 aa35.62■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmem87bQ8BKU8 555 aa35.62■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ifit1bl2Q3U687 466 aa35.61■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Clca2Q8BG22 942 aa35.61■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp19a1P28649 503 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atg4aQ8C9S8 396 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Col22a1E9Q7P1 1613 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa35.58■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rtkn2Q14B46 604 aa35.58■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ttc19Q8CC21 365 aa35.58■■■■□ 3.29
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Abcc4E9Q236 1325 aa35.57■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prl3d2F6R3P9 224 aa35.56■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kif18aQ91WD7 886 aa35.56■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MpndQ3TV65 487 aa35.55■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cct4P80315 539 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Foxo4Q9WVH3 505 aa35.55■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Npy5rO70342 466 aa35.54■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cops6O88545 324 aa35.54■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa35.54■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adora1Q60612 326 aa35.53■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ttc14Q9CSP9 761 aa35.53■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Spata31d1bE9QA57 1361 aa35.53■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NppbP40753 121 aa35.52■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa35.52■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gimap8Q75N62 688 aa35.51■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Amhr2Q8K592 568 aa35.51■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GptQ8QZR5 496 aa35.51■■■■□ 3.28
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa35.51■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa35.5■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa35.5■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MeiocA2AG06 965 aa35.5■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Susd4Q8BH32 490 aa35.5■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Apba2P98084 750 aa35.49■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zbtb38Q3LR78 1197 aa35.49■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zbtb3Q91X45 518 aa35.49■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ubn2Q80WC1 1314 aa35.47■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Greb1lB9EJV3 1913 aa35.47■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc146E9Q9F7 977 aa35.47■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q8C5K5 320 aa35.47■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wdr63B2RY71 923 aa35.47■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trim34bJ3QNR8 485 aa35.47■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa35.47■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dctn1O08788 1281 aa35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 166.1 ms