RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027592.5

Ubxn4-201, Transcript of UBX domain-containing protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn4, Length 4,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tm6sf1P58749 370 aa16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Snx13Q6PHS6 957 aa16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmco3Q8BH01 678 aa16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cavin1O54724 392 aa16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mroh2aD3Z750 1679 aa16.22■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mdm2P23804 489 aa16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Slu7Q8BHJ9 585 aa16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cwc25Q9DBF7 416 aa16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Igflr1Q3U4N7 345 aa16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ell2Q3UKU1 639 aa16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dusp9Q7TNL7 452 aa16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 GptQ8QZR5 496 aa16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hmg20bQ9Z104 317 aa16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Myo3aQ8K3H5 1613 aa16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Prune1Q8BIW1 454 aa16.21■□□□□ 0.19
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mlh1Q9JK91 760 aa16.21■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Setbp1Q9Z180 1582 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zscan20B2KFW1 1030 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Plch2A2AP18 1501 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm45015A0A140LII9 184 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm18336A0A140LIU8 765 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Bin1O08539 588 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 NapbP28663 298 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Syt1P46096 421 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 LyarQ08288 388 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tti2Q8BGV4 512 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Slc39a6Q8C145 765 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Bag1Q60739 355 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ifit2Q64112 472 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Chrna2Q91X60 512 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 NpatQ8BMA5 1420 aa16.2■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rad50P70388 1312 aa16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Map7d2A2AG50 781 aa16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cfap73J3QPZ5 306 aa16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gnl2Q99LH1 728 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Stxbp4Q9WV89 557 aa16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ercc3P49135 783 aa16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Krt25Q8VCW2 446 aa16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Bicdl1A0JNT9 577 aa16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Riok1Q922Q2 567 aa16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nphp3Q7TNH6 1325 aa16.19■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Lamb3Q61087 1168 aa16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Myom2Q14BI5 1463 aa16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 March6Q6ZQ89 909 aa16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Sel1lQ9Z2G6 790 aa16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Usp25P57080 1055 aa16.18■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Uggt2E9Q4X2 1504 aa16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pde4bB1AWC9 736 aa16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Anp32eP97822 260 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc34Q3UI66 367 aa16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ak2Q9WTP6 239 aa16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ces1hD3Z298 562 aa16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Kiaa0753Q6A000 959 aa16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Iqca1Q9CUL5 857 aa16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Prkab2Q6PAM0 271 aa16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cfap69Q8BH53 942 aa16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ift57Q8BXG3 429 aa16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Efcab2Q9CQ46 164 aa16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 ThemisQ8BGW0 636 aa16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa16.16■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Stk36Q69ZM6 1316 aa16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Chl1P70232 1209 aa16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zeb2Q9R0G7 1215 aa16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Jmjd4Q8BFT6 427 aa16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dnaaf4Q8R368 420 aa16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Srgap1Q91Z69 1062 aa16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Znf653Q6YND2 615 aa16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ano1Q8BHY3 960 aa16.15■□□□□ 0.18
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tsr2Q8C8T8 191 aa16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Serpina10Q8R121 448 aa16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Trim11Q99PQ2 467 aa16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 LratQ9JI60 231 aa16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cep170Q6A065 1588 aa16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 SympkQ80X82 1284 aa16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Larp6Q8BN59 492 aa16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pdcl2Q78Y63 240 aa16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Otud6bQ8K2H2 294 aa16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Slf2Q6P9P0 1278 aa16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmc2Q8R4P4 888 aa16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CebpzP53569 1052 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc102aQ3TMW1 549 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.4 ms