RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523961.5

CCNC-216, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 5

Gene CCNC, Length 1,152 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-216ENST00000523961 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
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CCNC-216ENST00000523961 IGKV3-11P04433 115 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 ATP1B1P05026 303 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 DDCP20711 480 aa11.64□□□□□ -0.55
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CCNC-216ENST00000523961 CDC26Q8NHZ8 85 aa11.64□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.551e-13■■■□□ 17.1
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CCNC-216ENST00000523961 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 MYOTQ9UBF9 498 aa11.64□□□□□ -0.55
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CCNC-216ENST00000523961 MAPK1P28482 360 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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CCNC-216ENST00000523961 HLCSP50747 726 aa11.63□□□□□ -0.55
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CCNC-216ENST00000523961 SSR4P51571 173 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 HK2P52789 917 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 FUT7Q11130 342 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 OR1C1Q15619 314 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 INAQ16352 499 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 GALNTL6Q49A17 601 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa11.63□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CCNC-216ENST00000523961 ATG16L1Q676U5 607 aa11.63□□□□□ -0.55
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