RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	APH1B	Q8WW43	257 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ASB12	Q8WXK4	309 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	MUL1	Q969V5	352 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PPCDC	Q96CD2	204 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TPD52L3	Q96J77	140 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RDH12	Q96NR8	316 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PITX2	Q99697	317 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	APOO	Q9BUR5	198 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	LHPP	Q9H008	270 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	GAREM1	Q9H706	876 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	NT5DC2	Q9H857	520 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	IL21R	Q9HBE5	538 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FGF22	Q9HCT0	170 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		5.5	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A0A6YYD5	115 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1W2PPW3	197 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1W2PRB8	838 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	LNP1	A1A4G5	178 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	C10orf142	B7Z368	130 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730		H3BMQ9	156 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730		M0QX08	132 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730		M0R129	80 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC1A7	O00341	560 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	GNGT2	O14610	69 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FFAR1	O14842	300 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	BCKDK	O14874	412 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PCDH17	O14917	1159 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	KMO	O15229	486 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	NDUFS4	O43181	175 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TBX19	O60806	448 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	LRP3	O75074	770 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAJB6	O75190	326 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SEMA7A	O75326	666 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	INMT	O95050	263 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	EPPIN	O95925	133 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	VIP	P01282	170 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	IL2RA	P01589	272 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	MT-ND2	P03891	347 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RRM2	P31350	389 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RYK	P34925	604 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	HOXD12	P35452	270 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	NUDT1	P36639	197 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	CRAT	P43155	626 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	MAPK9	P45984	424 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	STT3A	P46977	705 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	OR1E2	P47887	323 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	LIMS1	P48059	325 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	BNIP3	Q12983	259 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SCARB2	Q14108	478 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TCEA2	Q15560	299 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	FGD3	Q5JSP0	725 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC23	Q5W5X9	447 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	SAXO2	Q658L1	398 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF605	Q86T29	641 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	C17orf64	Q86WR6	236 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	LACC1	Q8IV20	430 aa		5.49	□□□□□ -1.53
C4BPB-208	ENST00000492730	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53

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