RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 DMWDQ09019 674 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 SYPL1Q16563 259 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 DUSP7Q16829 419 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 TMEM64Q6YI46 380 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 ABHD13Q7L211 337 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 DEFB123Q8N688 67 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 METTL25Q8N6Q8 603 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 C1orf216Q8TAB5 229 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 GRIP2Q9C0E4 1043 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 SEMA6CQ9H3T2 930 aa16.86■□□□□ 0.29
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM131Q92545 1883 aa16.86■□□□□ 0.29
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ACTB-201ENST00000331789 CDH3P22223 829 aa16.85■□□□□ 0.29
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ACTB-201ENST00000331789 DEFB110Q30KQ9 67 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 ARMC8Q8IUR7 673 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 ELP4Q96EB1 424 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 SPACA7Q96KW9 195 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 EPYCQ99645 322 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 FAM192AQ9GZU8 254 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa16.85■□□□□ 0.29
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ACTB-201ENST00000331789 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
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ACTB-201ENST00000331789 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
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ACTB-201ENST00000331789 NME6O75414 186 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
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ACTB-201ENST00000331789 UCKL1Q9NWZ5 548 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 P2RX2Q9UBL9 471 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 KCNE3Q9Y6H6 103 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTB-201ENST00000331789 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 PROS1P07225 676 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 NR2F1P10589 423 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
ACTB-201ENST00000331789 SPIBQ01892 262 aa16.83■□□□□ 0.28
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