RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311337.10

GNPDA1-201, Transcript of glucosamine-6-phosphate deaminase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPDA1, Length 2,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1-201ENST00000311337 RPS6KA2Q15349 733 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 PROX2Q3B8N5 592 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 ZNF404Q494X3 552 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 ZFP69Q49AA0 526 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 KANK2Q63ZY3 851 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 IFI44Q8TCB0 444 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 TSPEARQ8WU66 669 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 TWIST2Q8WVJ9 160 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 CXorf40BQ96DE9 158 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 KCNA7Q96RP8 456 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 MMP27Q9H306 513 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 OR6C74A6NCV1 312 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 HAT1O14929 419 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 AZIN1O14977 448 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 KLF4O43474 513 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 PCDHGA12O60330 932 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 SH3BGRLO75368 114 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 C1orf105O95561 183 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 AGR2O95994 175 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 VIPP01282 170 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 FTH1P02794 183 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 LBPP18428 481 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 IFNA8P32881 189 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 RYKP34925 604 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 NUDT1P36639 197 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 PDX1P52945 283 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 KCNK10P57789 538 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 EMX2Q04743 252 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 NPTX1Q15818 432 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 DBX2Q6ZNG2 339 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 PDZD3Q86UT5 571 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 HS3ST5Q8IZT8 346 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 RNF175Q8N4F7 328 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 NACC2Q96BF6 587 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 MED8Q96G25 268 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 TGM7Q96PF1 710 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 PKP4Q99569 1192 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 ICKQ9UPZ9 632 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.59□□□□□ -0.87
GNPDA1-201ENST00000311337 PTPRBP23467 1997 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 EFCAB9A8MZ26 197 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 ANGPTL1O95841 491 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 PRKACBP22694 351 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 GRK6P43250 576 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 HTR3AP46098 478 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 OR2B6P58173 313 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 IL2P60568 153 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 CHRNB3Q05901 458 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 FADDQ13158 208 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 DGCR6Q14129 220 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 RCAN2Q14206 197 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 PFKFB4Q16877 469 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 C14orf28Q4W4Y0 310 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 GKN2Q86XP6 184 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 RHEBL1Q8TAI7 183 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 ASB11Q8WXH4 323 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 TRIM63Q969Q1 353 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 TUBGCP3Q96CW5 907 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 FAM122AQ96E09 287 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 NLGN3Q9NZ94 848 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 SLAMF8Q9P0V8 285 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 DNAJB9Q9UBS3 223 aa9.58□□□□□ -0.88
GNPDA1-201ENST00000311337 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms