RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vwa8Q8CC88 1905 aa9.5□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim30bE9PVL6 203 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 2610001J05RikF2Z3Y9 59 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sod3O09164 251 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Htr3aP23979 487 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rph3aP47708 681 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 EgflamQ4VBE4 1017 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pum2Q80U58 1066 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pan2Q8BGF7 1200 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppm1nQ8BGL1 404 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acad9Q8JZN5 625 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ces2aQ8QZR3 558 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stx19Q8R1Q0 292 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Camkk1Q8VBY2 505 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cox18Q8VC74 331 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NclnQ8VCM8 563 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clec14aQ8VCP9 459 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Erlec1Q8VEH8 483 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr818Q8VG46 318 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rwdd2bQ99M03 290 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pdzk1ip1Q9CQH0 114 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ctrb1Q9CR35 263 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc25a30Q9CR58 291 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 L3hypdhQ9CXA2 354 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kdm8Q9CXT6 414 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MmabQ9D273 237 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Elf4Q9Z2U4 655 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Alpk2Q91ZB0 2144 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CroccQ8CJ40 2009 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm12800B1AUV4 484 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dcdc2bF7BCK0 340 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r21K7N6Y7 853 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r20L7N2B1 853 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Opn1swP51491 346 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fgf9P54130 208 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 B3gat3P58158 335 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AmbpQ07456 349 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gal3st4Q3V1B8 480 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pwwp2aQ69Z61 730 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1046Q7TR79 316 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Creg2Q8BGC9 288 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kctd7Q8BJK1 289 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smyd4Q8BTK5 799 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Abhd18Q8C1A9 464 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Abi1Q8CBW3 481 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pih1d2Q8CHR9 315 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Samd14Q8K070 417 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr541Q8VGM0 312 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Impa2Q91UZ5 290 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tnfrsf12aQ9CR75 129 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp773Q9CZ29 471 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ap1s2Q9DB50 160 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Uqcrc2Q9DB77 453 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp2d22Q9JKY7 500 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcnd3Q9Z0V1 655 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Uba2Q9Z1F9 638 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Btnl4A2CG29 586 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm21904A8HG57 180 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8180E9PXN0 145 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r118E9Q1C1 853 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tsc22d2E9Q7M2 769 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm21866J3QMH4 180 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rpl7P14148 270 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TtkP35761 856 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Timm13P62075 95 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dgcr2P98154 548 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rbbp4Q60972 425 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il10rbQ61190 349 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Meig1Q61845 88 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il20raQ6PHB0 546 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prr11Q8BHE0 368 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8BL95 290 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lysmd4Q8CC84 293 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sec14l4Q8R0F9 403 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hbp1Q8R316 516 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Uckl1Q91YL3 548 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf146Q9CZW6 359 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ankrd7Q9D504 279 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pnp2Q9D8C9 305 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Izumo2Q9DA16 220 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aff4Q9ESC8 1160 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cldn9Q9Z0S7 217 aa9.49□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mamdc4A2AJA7 1228 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adam3F8VQ03 822 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cldn20G5E8X0 219 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AhrP30561 848 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rps25P62852 125 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Afg1lQ3V384 480 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spin1Q61142 262 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Senp5Q6NXL6 749 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DraxinQ6PAL1 343 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RubcnQ80U62 956 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vps37aQ8CHS8 397 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Glis2Q8VDL9 521 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1052Q8VGR8 312 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cacng6Q8VHW3 260 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppp1r16aQ923M0 524 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spef1Q99JL1 234 aa9.48□□□□□ -0.89
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim13Q9CYB0 407 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.4 ms