RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 C10orf82Q8WW14 230 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SLAMF9Q96A28 289 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 RHBDF1Q96CC6 855 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CERS2Q96G23 380 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SERAC1Q96JX3 654 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SERPINB11Q96P15 392 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM111AQ96PZ2 611 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6C1Q96RD1 312 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GAL3ST4Q96RP7 486 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC22A12Q96S37 553 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 RTP3Q9BQQ7 232 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 HAUS8Q9BT25 410 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TSSK1BQ9BXA7 367 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 FTHL17Q9BXU8 183 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO44Q9H4M3 255 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ECT2Q9H8V3 914 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC40Q9H9A6 602 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D17Q9HA65 648 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 LMAN1LQ9HAT1 526 aa3.97□□□□□ -1.77
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CAPNS1-210ENST00000590211 BFARQ9NZS9 450 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ACTR3BQ9P1U1 418 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC17A7Q9P2U7 560 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TRPC4Q9UBN4 977 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 OR12D3Q9UGF7 316 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GRID1Q9ULK0 1009 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF150Q9ULK6 438 aa3.97□□□□□ -1.77
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CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MICAL3Q7RTP6 2002 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 NUP205Q92621 2012 aa3.97□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD36A6QL64 1941 aa3.96□□□□□ -1.78
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CAPNS1-210ENST00000590211 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGEB16A2A368 324 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM221A6NGB7 291 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP42A6NI28 874 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 B4DGG1 531 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM72CH0Y354 149 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNK1O00180 336 aa3.96□□□□□ -1.78
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CAPNS1-210ENST00000590211 XRCC3O43542 346 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SSX4O60224 188 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SOCS5O75159 536 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 PIAS1O75925 651 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ANXA9O76027 345 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 DDHD2O94830 711 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC16A8O95907 504 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC2A3P11169 496 aa3.96□□□□□ -1.78
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CAPNS1-210ENST00000590211 EFEMP1Q12805 493 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CDH17Q12864 832 aa3.96□□□□□ -1.78
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CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB17Q13105 803 aa3.96□□□□□ -1.78
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CAPNS1-210ENST00000590211 FUT11Q495W5 492 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 AARDQ4LEZ3 155 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TEX44Q53QW1 395 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 DCST1Q5T197 706 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 STXBP5Q5T5C0 1151 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 GRTP1Q5TC63 336 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM72AQ5TYM5 149 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM72DQ6L9T8 149 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CD300LGQ6UXG3 332 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SH2D5Q6ZV89 423 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 NLRP9Q7RTR0 991 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNMB4Q86W47 210 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM72BQ86X60 149 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CRLF3Q8IUI8 442 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
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