RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509351.5

VNN3-211, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VNN3, Length 1,700 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-211ENST00000509351 C16orf62Q7Z3J2 963 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 VSTM4Q8IW00 320 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 OR5D13Q8NGL4 314 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 OR13J1Q8NGT2 312 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 THAP6Q8TBB0 222 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 CCDC107Q8WV48 283 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 SUSD6Q92537 303 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 NRBF2Q96F24 287 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 CXorf58Q96LI9 332 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 BPIFA3Q9BQP9 254 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 GANQ9H2C0 597 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 MARCH7Q9H992 704 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 CD320Q9NPF0 282 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 SEC14L3Q9UDX4 400 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 BCAP29Q9UHQ4 241 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 NSG2Q9Y328 171 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 RNF115Q9Y4L5 304 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 ZHX2Q9Y6X8 837 aa4.9□□□□□ -1.62
VNN3-211ENST00000509351 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 RNF222A6NCQ9 220 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 TCP11X1B4DZS4 312 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 NPIPA2E9PIF3 369 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 CHEK1O14757 476 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 KCNAB3O43448 404 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 SYT7O43581 403 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 GRAP2O75791 330 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 NEBLO76041 1014 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 CHRNA1P02708 482 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 MED14OSP0DP75 135 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 ODC1P11926 461 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 CNR2P34972 360 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 NF2P35240 595 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 MNDAP41218 407 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 BNC1Q01954 994 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 SP3Q02447 781 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 HYAL1Q12794 435 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 NME3Q13232 169 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 CAMK4Q16566 473 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 CTF1Q16619 201 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 HKDC1Q2TB90 917 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 XKR3Q5GH77 459 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 FGFBP3Q8TAT2 258 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 Q8TCH9 128 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 SEPT8Q92599 483 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 FAM20AQ96MK3 541 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 CHP1Q99653 195 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 FUNDC2Q9BWH2 189 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 VN1R1Q9GZP7 353 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 C5orf66Q9H5L9 145 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 ADAM21Q9UKJ8 722 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 YIPF1Q9Y548 306 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 V9GYY5 206 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 KIF7Q2M1P5 1343 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 HEATR9A2RTY3 570 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 TMEM191CA6NGB0 347 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 PATE3B3GLJ2 98 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 CCL24O00175 119 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 TIMM23O14925 209 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 OR1F1O43749 312 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 NDUFS7O75251 213 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 SERPINI2O75830 405 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 RNF8O76064 485 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 BMP10O95393 424 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 LGI1O95970 557 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 CSTAP01040 98 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 ERVK-10P10266 1014 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 ACP2P11117 423 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 F3P13726 295 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 EZRP15311 586 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 CYP11B1P15538 503 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 CHRNB2P17787 502 aa4.89□□□□□ -1.63
VNN3-211ENST00000509351 TPSB2P20231 275 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms