RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 WDR1O75083 606 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 P04436 131 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 CCDC166P0CW27 439 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 CRABP2P29373 138 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 CASP2P42575 452 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 MSH2P43246 934 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 MAN2A2P49641 1150 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SERPINB9P50453 376 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ATP6V0D1P61421 351 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 MYBPHQ13203 477 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 OR4D1Q15615 310 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 PIGGQ5H8A4 983 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 PAGE2BQ5JRK9 111 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 MROH9Q5TGP6 573 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ADGRD1Q6QNK2 874 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 TAOK1Q7L7X3 1001 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 LIX1LQ8IVB5 337 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ACOT4Q8N9L9 421 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SNX31Q8N9S9 440 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 C7orf57Q8NEG2 295 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 NUBPLQ8TB37 319 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SARAFQ96BY9 339 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 IGSF5Q9NSI5 407 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 COPS7AQ9UBW8 275 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 L3MBTL1Q9Y468 752 aa18.37■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 RTCAO00442 366 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 HCN1O60741 890 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ATP6AP2O75787 350 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ADH7P40394 386 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 DLX5P56178 289 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ID2Q02363 134 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 CHIT1Q13231 466 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SLC29A2Q14542 456 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SLC10A1Q14973 349 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 C1orf185Q5T7R7 199 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 LYPD8Q6UX82 237 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 CCDC91Q7Z6B0 441 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 CMC1Q7Z7K0 106 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 C9orf40Q8IXQ3 194 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 MYRIPQ8NFW9 859 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 DCAKDQ8WVC6 231 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 NRGNQ92686 78 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 UBXN10Q96LJ8 280 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 FETUBQ9UGM5 382 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SPACA6W5XKT8 324 aa18.36■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 FREM3P0C091 2139 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 NINQ8N4C6 2090 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 FGF17O60258 216 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ZWINTO95229 277 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 NADKO95544 446 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 IGKV3-11P04433 115 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SLC35E2BP0CK96 405 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 CPN2P22792 545 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 CNTFP26441 200 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 STT3AP46977 705 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SERPINB8P50452 374 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 IST1P53990 364 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 IRF8Q02556 426 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ASPHQ12797 758 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 TMEM35AQ53FP2 167 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 WLSQ5T9L3 541 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 RAPH1Q70E73 1250 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 LAS2Q8IYD9 372 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 PAQR8Q8TEZ7 354 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 CXXC4Q9H2H0 198 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 LDAHQ9H6V9 325 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SNX15Q9NRS6 342 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 CD274Q9NZQ7 290 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SPRR3Q9UBC9 169 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ACAD8Q9UKU7 415 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 AKAP6Q13023 2319 aa18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 COX7A2P14406 83 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 GCAP28676 217 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 PIGAP37287 484 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SLC22A8Q8TCC7 542 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 NINJ1Q92982 152 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 UBE2E3Q969T4 207 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 ISL2Q96A47 359 aa18.34■□□□□ 0.53
NELFE-212ENST00000492539 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms