RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEIL3Q8TAT5 605 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC46Q96FV0 321 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ART5Q96L15 291 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRM3Q9NNZ6 103 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACKR4Q9NPB9 350 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DMRT3Q9NQL9 472 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DLL4Q9NR61 685 aa12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HRKO00198 91 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DVL2O14641 736 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH3BGRLO75368 114 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM155BO75949 473 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC166P0CW27 439 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD1DP15813 335 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMP5P22003 454 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6V0D1P61421 351 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E2F2Q14209 437 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4D1Q15615 310 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP5B1Q2VPB7 878 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM35AQ53FP2 167 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAMR1Q6UXH9 720 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM13CQ8NE31 585 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR10G3Q8NGC4 313 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM222BQ8WU58 562 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2E3Q969T4 207 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL20Q96IG2 436 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT12Q99456 494 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHACTR1Q9C0D0 580 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAB39LQ9H9S4 337 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PROK2Q9HC23 129 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNIH4Q9P003 139 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBLCQ9ULV8 474 aa12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP12.11□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E7ESA3 106 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAP18O00422 153 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGFB1P01137 390 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO45P0C2W1 286 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCNAP12004 261 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRD2P14416 443 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASP2P42575 452 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRPC1P48995 793 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DGKQP52824 942 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DR1Q01658 176 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFRSF17Q02223 184 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BIKQ13323 160 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHSY3Q70JA7 882 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC29A4Q7RTT9 530 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAS2Q8IYD9 372 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNIP2Q8NFZ5 429 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXT2Q93063 718 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBD6Q96DN6 1003 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN17Q96FV3 270 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAL3ST4Q96RP7 486 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOHHQ9BU89 302 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMYD2Q9NRG4 433 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD274Q9NZQ7 290 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCA2Q9BZC7 2435 aa12.1□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TP73O15350 636 aa12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIAS1O75925 651 aa12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRATO95237 230 aa12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPPINO95925 133 aa12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 S100BP04271 92 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOSL1P15407 271 aa12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TACR1P25103 407 aa12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDF1P27539 372 aa12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINB3P29508 390 aa12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINB1P30740 379 aa12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT3P56703 355 aa12.09□□□□□ -0.47
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HERVK_113P63132 956 aa12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms