RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 REEP3Q6NUK4 255 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 B3GNT7Q8NFL0 401 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CDADC1Q9BWV3 514 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52A5Q9H2C5 316 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCB10Q9NRK6 738 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 FTSJ1Q9UET6 329 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 KCND3Q9UK17 655 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNK6Q9Y257 313 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 HTR3EA5X5Y0 456 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 GASTP01350 101 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 COLEC12Q5KU26 742 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 AMER2Q8N7J2 671 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 FRMD1Q8N878 549 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 AQP11Q8NBQ7 271 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 FLCNQ8NFG4 579 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CRELD1Q96HD1 420 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 NLNQ9BYT8 704 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXL12Q9NXK8 326 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ZAR1LA6NP61 321 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 IFNW1P05000 195 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ACP5P13686 325 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 RGS6P49758 472 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC13A2Q13183 592 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ARMCX4Q5H9R4 360 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 PNCKQ6P2M8 343 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL17Q6TDP4 642 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ENOPH1Q9UHY7 261 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF229Q9UJW7 825 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 PLPP1O14494 284 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 FFAR1O14842 300 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPINB1P30740 379 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CRISP3P54108 245 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC42P60953 191 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP4F2P78329 520 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CDK3Q00526 305 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SELENBP1Q13228 472 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT78Q8N1N4 520 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 RAD51AP1Q96B01 352 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CDCA4Q9BXL8 241 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL25Q9H0H3 589 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TRPV4Q9HBA0 871 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SLAMF7Q9NQ25 335 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 RHCGQ9UBD6 479 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX8Q9Y5X2 465 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CFAP54Q96N23 3096 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SH3D21A4FU49 640 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 DDCP20711 480 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 COL9A1P20849 921 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CHMP24386 653 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM196Q5HYL7 178 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SAXO2Q658L1 398 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 STEAP3Q658P3 488 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 FRMPD2BQ6IN97 320 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CEACAM20Q6UY09 585 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 NEURL3Q96EH8 262 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 OR51E2Q9H255 320 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 RHBGQ9H310 441 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 XKR8Q9H6D3 395 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 DZANK1Q9NVP4 752 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 AHSPQ9NZD4 102 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA7Q9P0W8 599 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 H0Y8X5 98 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 VEGFDO43915 354 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 EGFP01133 1207 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 POU2F2P09086 479 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 DBTP11182 482 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CRISP1P54107 249 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 LIM2P55344 173 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 OLR1P78380 273 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 NLGN4XQ8N0W4 816 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC38A5Q8WUX1 472 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 IFT52Q9Y366 437 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ADRA2AP08913 450 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 KELP23276 732 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CLDN2P57739 230 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF45Q02386 682 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKCDQ05655 676 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 IRF4Q15306 451 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TPRG1LQ5T0D9 272 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 DEPDC1Q5TB30 811 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 HORMAD2Q8N7B1 307 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5P2Q8WZ92 322 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TM4SF18Q96CE8 201 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 S1PR5Q9H228 398 aa17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms