RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354376.3

C9orf163-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 163, humanhuman

Gene C9orf163, Length 2,572 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163-201ENST00000354376 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 TFPTP0C1Z6 253 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 OR12D1P0DN82 309 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 CCT3P49368 545 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 OR2L8Q8NGY9 312 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 PIP5K1AQ99755 562 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 THSD1Q9NS62 852 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 FBXW2Q9UKT8 454 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ATG4BQ9Y4P1 393 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 LCKP06239 509 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 PRKAG1P54619 331 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 GPR19Q15760 415 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 CTF1Q16619 201 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 LACC1Q8IV20 430 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 OR2L3Q8NG85 312 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 RAB2BQ8WUD1 216 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 KCNK12Q9HB15 430 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 TMEM9Q9P0T7 183 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 PSME2Q9UL46 239 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 TPRKBQ9Y3C4 175 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.38■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 VCANP13611 3396 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 TGFBR1P36897 503 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 TNFRSF4P43489 277 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 SLAMF1Q13291 335 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 C18orf63Q68DL7 685 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 OR1E3Q8WZA6 343 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 PROX1Q92786 737 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF347Q96SE7 839 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 PLGRKTQ9HBL7 147 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 SCN3BQ9NY72 215 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 KNL1Q8NG31 2342 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 GPR89AB7ZAQ6 455 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 C5orf58C9J3I9 102 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ANHXE9PGG2 379 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 GASTP01350 101 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 GPR89BP0CG08 455 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 FRKP42685 505 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 OCA2Q04671 838 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 LRRC32Q14392 662 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 LEXMQ3ZCV2 418 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ENPP7Q6UWV6 458 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ARMC8Q8IUR7 673 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 SHISA5Q8N114 240 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 MS4A6EQ96DS6 147 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 NT5DC2Q9H857 520 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ENPP4Q9Y6X5 453 aa21.37■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 A0A1W2PR48 441 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 CLEC3AO75596 197 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 DNAJB5O75953 348 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 GADD45GO95257 159 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 CERS1P27544 350 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 PSMB9P28065 219 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF605Q86T29 641 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 RAB42Q8N4Z0 105 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 FRMD1Q8N878 549 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 XAGE5Q8WWM1 108 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 RORBQ92753 470 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ENPP5Q9UJA9 477 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 PRSS38A1L453 326 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 MFN2O95140 757 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF24P17028 368 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ACSL1P33121 698 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 LIMS1P48059 325 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 AMDHD1Q96NU7 426 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 GABRG3Q99928 467 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ISM1B1AKI9 464 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 RGS10O43665 173 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 BCL10O95999 233 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 TEAD1P28347 426 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 CTHP32929 405 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 GPC1P35052 558 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 GGT2P36268 569 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ZIC1Q15915 447 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 PROX2Q3B8N5 592 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 CCDC116Q8IYX3 515 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 AQP11Q8NBQ7 271 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 QRFPRQ96P65 431 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 OR51I1Q9H343 314 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 PRDM7Q9NQW5 492 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF226Q9NYT6 803 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf163-201ENST00000354376 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms