RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268717.9

COPS3-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS3, Length 1,641 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-201ENST00000268717 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 CBFA2T3O75081 653 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 PRKD3O94806 890 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 NTRK1P04629 796 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 UQCRBP14927 111 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ST6GAL1P15907 406 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 SOAT1P35610 550 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 CRATP43155 626 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 NR1D2Q14995 579 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 CBLL1Q75N03 491 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 FBXO30Q8TB52 745 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 FAM110BQ8TC76 370 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ZNF597Q96LX8 424 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 Q9H521 79 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.5□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 TLCD2A6NGC4 264 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 TPST1O60507 370 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 C1QCP02747 245 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ARAFP10398 606 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ETFAP13804 333 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 GPR3P46089 330 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 PPP1CAP62136 330 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 SHBQ15464 509 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 IRGCQ6NXR0 463 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 SPRED1Q7Z699 444 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 RNF130Q86XS8 419 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 BBS4Q96RK4 519 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 DAPP1Q9UN19 280 aa14.49□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 YKT6O15498 198 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 SEMG1P04279 462 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 IFI6P09912 130 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 MPIP34949 423 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 PRIM2P49643 509 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 LIM2P55344 173 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 SKP1P63208 163 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 NKG7Q16617 165 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 COX20Q5RI15 118 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 C10orf90Q96M02 699 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 CIB1Q99828 191 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 C5AR2Q9P296 337 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ACSL6Q9UKU0 697 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 SPACA6W5XKT8 324 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 PGRMC2O15173 223 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 SDC3O75056 442 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 NUDT7P0C024 238 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 DSTNP60981 165 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 HSPB3Q12988 150 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 SCARB2Q14108 478 aa14.48□□□□□ -0.09
COPS3-201ENST00000268717 SPIDRQ14159 915 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms