RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223423.8

PTGS1-201, Transcript of prostaglandin-endoperoxide synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGS1, Length 2,328 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1-201ENST00000223423 HMGB4Q8WW32 186 aa11.85□□□□□ -0.51
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PTGS1-201ENST00000223423 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTGS1-201ENST00000223423 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PTGS1-201ENST00000223423 SNX5Q9Y5X3 404 aa11.83□□□□□ -0.52
PTGS1-201ENST00000223423 C10orf142B7Z368 130 aa11.82□□□□□ -0.52
PTGS1-201ENST00000223423 ZW10O43264 779 aa11.82□□□□□ -0.52
PTGS1-201ENST00000223423 SLC28A2O43868 658 aa11.82□□□□□ -0.52
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PTGS1-201ENST00000223423 SEMA4FO95754 770 aa11.82□□□□□ -0.52
PTGS1-201ENST00000223423 VIPP01282 170 aa11.82□□□□□ -0.52
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