RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pld3O35405 488 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LdhcP00342 332 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DhfrP00375 187 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H2-K1P01901 369 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 JundP15066 341 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DctP29812 517 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cav3P51637 151 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab2bP59279 216 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Coq7P97478 217 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zc3h12aQ5D1E7 596 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr318Q5NCD7 306 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Havcr1Q5QNS5 305 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gdi2Q61598 445 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atg16l2Q6KAU8 623 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 WdcpQ6NV72 663 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prrg3Q6PAQ9 231 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1045Q7TR80 315 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lats2Q7TSJ6 1042 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rgs8Q8BXT1 180 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Micu2Q8CD10 432 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akr1d1Q8VCX1 325 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gtf2h3Q8VD76 309 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1461Q8VEV7 312 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1033Q8VFK5 310 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr166Q8VGX2 312 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acot7Q91V12 381 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mapk8Q91Y86 384 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Use1Q9CQ56 270 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Marc1Q9CW42 340 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sp2Q9D2H6 612 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cib4Q9D9N5 185 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spata19Q9DAQ9 154 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd302Q9DCG2 228 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btnl10Q9JK39 275 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tlr4Q9QUK6 835 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrepQ9QUR6 710 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nfkb2Q9WTK5 899 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Elf4Q9Z2U4 655 aa6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nup210Q9QY81 1886 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm14744B1AVU4 173 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cldn34b1B1AZQ8 209 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kif28pD3YXS5 1028 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc7bE9Q9Y3 381 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3476K7N6V0 257 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r9K7N6Z8 848 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r95L7N274 845 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DdostO54734 441 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stmn3O70166 180 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CkmP07310 381 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hmgn1P18608 96 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DcnP28654 354 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hoxc5P32043 222 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Yap1P46938 488 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nsg2P47759 171 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Emp1P47801 160 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igfbp3P47878 292 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Opn1swP51491 346 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tsc22d1P62500 1077 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rps26P62855 115 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cds1P98191 461 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrkczQ02956 592 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Macrod2Q3UYG8 475 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ephx3Q3V1F8 367 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MuskQ61006 868 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5416Q6IE28 97 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dpp10Q6NXK7 797 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ClmQ7TSN2 230 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acp6Q8BP40 418 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bbs4Q8C1Z7 520 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdkl1Q8CEQ0 352 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spin4Q8K1L2 249 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pphln1Q8K2H1 381 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1417Q8VGJ6 315 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pfdn1Q9CWM4 122 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Naalad2Q9CZR2 740 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Creb3l4Q9D2A5 370 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 5430402E10RikQ9D3N5 173 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RtcAQ9D7H3 366 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcne2Q9D808 123 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cldn34b2Q9D9N2 209 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IL36RNQ9QYY1 156 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dpp6Q9Z218 804 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CcniQ9Z2V9 377 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spats1A2RRY8 269 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r9A2RST7 299 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tyw5A2RSX7 315 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Skint2A7XUX6 400 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp472B0V2W5 534 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr592E9PYB3 312 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm11239E9Q5Z9 360 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm11237F2Z3W5 360 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm11238F2Z478 360 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp871G5E905 615 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GypaP14220 168 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klkb1P26262 638 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cers1P27545 350 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hoxd1Q01822 328 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyb5r4Q3TDX8 528 aa6.3□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Upf3aQ3ULJ3 422 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.1 ms