Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCX1

Akr1d1, 3-oxo-5-beta-steroid 4-dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akr1d1Q8VCX1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Akr1d1Q8VCX1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Akr1d1Q8VCX1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Akr1d1Q8VCX1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Akr1d1Q8VCX1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Akr1d1Q8VCX1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Akr1d1Q8VCX1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Akr1d1Q8VCX1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Akr1d1Q8VCX1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Akr1d1Q8VCX1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Akr1d1Q8VCX1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Akr1d1Q8VCX1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Akr1d1Q8VCX1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Akr1d1Q8VCX1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Akr1d1Q8VCX1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Akr1d1Q8VCX1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Akr1d1Q8VCX1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Akr1d1Q8VCX1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Akr1d1Q8VCX1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Akr1d1Q8VCX1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Akr1d1Q8VCX1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Akr1d1Q8VCX1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Akr1d1Q8VCX1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Akr1d1Q8VCX1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Akr1d1Q8VCX1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Akr1d1Q8VCX1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Akr1d1Q8VCX1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Akr1d1Q8VCX1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Akr1d1Q8VCX1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Akr1d1Q8VCX1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Akr1d1Q8VCX1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Akr1d1Q8VCX1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Akr1d1Q8VCX1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Akr1d1Q8VCX1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Akr1d1Q8VCX1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Akr1d1Q8VCX1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Akr1d1Q8VCX1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Akr1d1Q8VCX1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Akr1d1Q8VCX1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Akr1d1Q8VCX1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Akr1d1Q8VCX1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Akr1d1Q8VCX1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Akr1d1Q8VCX1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Akr1d1Q8VCX1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Akr1d1Q8VCX1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Akr1d1Q8VCX1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Akr1d1Q8VCX1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Akr1d1Q8VCX1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Akr1d1Q8VCX1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Akr1d1Q8VCX1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Akr1d1Q8VCX1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Akr1d1Q8VCX1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Akr1d1Q8VCX1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Akr1d1Q8VCX1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Akr1d1Q8VCX1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Akr1d1Q8VCX1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Akr1d1Q8VCX1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Akr1d1Q8VCX1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Akr1d1Q8VCX1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Akr1d1Q8VCX1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Akr1d1Q8VCX1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Akr1d1Q8VCX1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Akr1d1Q8VCX1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Akr1d1Q8VCX1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Akr1d1Q8VCX1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Akr1d1Q8VCX1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Akr1d1Q8VCX1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Akr1d1Q8VCX1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Akr1d1Q8VCX1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Akr1d1Q8VCX1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Akr1d1Q8VCX1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Akr1d1Q8VCX1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Akr1d1Q8VCX1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Akr1d1Q8VCX1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Akr1d1Q8VCX1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Akr1d1Q8VCX1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Akr1d1Q8VCX1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Akr1d1Q8VCX1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Akr1d1Q8VCX1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Akr1d1Q8VCX1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Akr1d1Q8VCX1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Akr1d1Q8VCX1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Akr1d1Q8VCX1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Akr1d1Q8VCX1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Akr1d1Q8VCX1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Akr1d1Q8VCX1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Akr1d1Q8VCX1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Akr1d1Q8VCX1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Akr1d1Q8VCX1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Akr1d1Q8VCX1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Akr1d1Q8VCX1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Akr1d1Q8VCX1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Akr1d1Q8VCX1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Akr1d1Q8VCX1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Akr1d1Q8VCX1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Akr1d1Q8VCX1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Akr1d1Q8VCX1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Akr1d1Q8VCX1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Akr1d1Q8VCX1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Akr1d1Q8VCX1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms