RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrgprb3Q91ZC1 312 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4930412O13RikQ9D5M9 106 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Glod5Q9D8I3 148 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mfsd1Q9DC37 464 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spag6Q9JLI7 507 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plek2Q9WV52 353 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aldh18a1Q9Z110 795 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B4galt2Q9Z2Y2 369 aa10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hcfc1Q61191 2045 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arid1bE9Q4N7 2244 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcnx2Q5DU28 2122 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scn2aA0A0J9YTW6 2006 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfrsf14A0A1W2P7D5 276 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r74E9PW21 853 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8444F6XS56 118 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdk4O70571 412 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01634 136 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hspa1bP17879 642 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Etv2P41163 335 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Oprm1P42866 398 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl36P47964 105 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dppa5bP85965 119 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usp39Q3TIX9 564 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mocs1Q5RKZ7 636 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nab1Q61122 486 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Paqr3Q6TCG8 311 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TufmQ8BFR5 452 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P4htmQ8BG58 503 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Coq4Q8BGB8 266 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp52Q8BJ45 724 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psd4Q8BLR5 1005 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Coro2aQ8C0P5 524 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CntrobQ8CB62 887 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FlcnQ8QZS3 579 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd209dQ91ZW8 237 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Far1Q922J9 515 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem53Q9D0Z3 276 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nacc2Q9DCM7 586 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 KelQ9EQF2 713 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gtf2h2Q9JIB4 396 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FetubQ9QXC1 388 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sema6cQ9WTM3 931 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc22a4Q9Z306 553 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Map1aQ9QYR6 2776 aa10.43□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cacna1cQ01815 2139 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trbc2A0A075B5J4 173 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rasgef1aA0A0N4SVR5 498 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cytl1A1E5L0 139 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc9bA3KGF9 545 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Muc3E9PWP7 378 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ap1arE9PYF7 298 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3187M0QWW3 260 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Foxq1O70220 400 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wnt2bO70283 389 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 F2rl3O88634 396 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01851 173 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtnd5P03921 607 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-Eb1P04230 264 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Surf2P09926 257 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ube2e3P52483 207 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab8bP61028 207 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FhP97807 507 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gch1Q05915 241 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajb14Q149L6 379 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 UcmaQ14BU0 138 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tspyl3Q3UYP3 334 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc47a2Q3V050 573 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zmat1Q3V0C1 714 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Taok1Q5F2E8 1001 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr39Q5U431 456 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdkn2cQ60772 168 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Art1Q60935 325 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist2h2acQ64523 129 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist2h2aa1Q6GSS7 130 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BC061237Q6P8I2 184 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zc3h12dQ8BIY3 533 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bpifb6Q8BU51 449 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8BWQ6 963 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AopepQ8BXQ6 817 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8C3W1 322 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Erich5Q8K0S2 362 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr769Q8K501 312 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r33Q8R2E0 305 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr976Q8VF15 326 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acss1Q99NB1 682 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tsnaxip1Q99P25 704 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc19a3Q99PL8 488 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ArpinQ9D0A3 226 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dusp21Q9D9D8 189 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss52Q9D9M0 321 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfpl1Q9DB43 310 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdc40Q9DC48 579 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Foxo1Q9R1E0 652 aa10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HnrnpfQ9Z2X1 415 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prrc2cQ3TLH4 2846 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcrg-V7A0A0A6YYE8 116 aa10.41□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd163l1A0A1B0GSB0 991 aa10.41□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21885A0A286YDN8 145 aa10.41□□□□□ -0.74
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm4871D3Z0W7 314 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.5 ms