RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 PAMR1Q6UXH9 720 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 LNX2Q8N448 690 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKFN1Q8N957 763 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 SUN3Q8TAQ9 357 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 NEIL2Q969S2 332 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 C3orf30Q96M34 536 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 INPP5KQ9BT40 448 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM184CQ9NVA4 438 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 C14orf105Q9NVL8 296 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 CAPN14A8MX76 684 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 ANHXE9PGG2 379 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 FAAHO00519 579 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 HPRP00739 348 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 THEGLP0DJG4 465 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 TUBA3CQ13748 450 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC14A2Q15849 920 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 GALNT12Q8IXK2 581 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 PGBD5Q8N414 524 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 OR51A7Q8NH64 312 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 FBRSQ9HAH7 460 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 SMOXQ9NWM0 555 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 CDRT1O95170 752 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 ACSL1P33121 698 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 CSNK1DP48730 415 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 RCAN2Q14206 197 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 NRAPQ86VF7 1730 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 UGDHO60701 494 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNJ13O60928 360 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP17A1P05093 508 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 HHEXQ03014 270 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 NPRL3Q12980 569 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 DNM1P34Q6PK57 102 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF550Q7Z398 422 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 YIPF7Q8N8F6 280 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 OR52P1PQ8NH57 321 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 C1orf216Q8TAB5 229 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM19Q96HH6 336 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 ASPNQ9BXN1 380 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 SP140LQ9H930 580 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 UBAP1Q9NZ09 502 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 SCN9AQ15858 1988 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1W2PQ72 361 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 PRODHO43272 600 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 NUAK1O60285 661 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGEF15O94989 841 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 DBIP07108 87 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 GPX3P22352 226 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 S100GP29377 79 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 VBP1P61758 197 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 DTWD1Q8N5C7 304 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 OR52N2Q8NGI0 321 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 OR51G2Q8NGK0 314 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRJ-208ENST00000615445 LILRB3O75022 631 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 TUBA1BP68363 451 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 TUBA1AQ71U36 451 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 THEM6Q8WUY1 208 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 FATE1Q969F0 183 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 HHIPL1Q96JK4 782 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 FEVQ99581 238 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 TM9SF2Q99805 663 aa19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 ORC5O43913 435 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 ARL6IP5O75915 188 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 APOL3O95236 402 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 PORP16435 677 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 RHCEP18577 417 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 TAS2R38P59533 333 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPAN5P62079 268 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 MGAT3Q09327 533 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 DSG2Q14126 1118 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPRRQ15256 657 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKMY1Q9P2S6 941 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 MKLN1Q9UL63 735 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 HCRTR2O43614 444 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 SDC1P18827 310 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 ERVFC1P60507 584 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF33BQ06732 778 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 FCHO2Q0JRZ9 810 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 SEMA3BQ13214 749 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 CTC1Q2NKJ3 1217 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 GAREM2Q75VX8 874 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 C20orf27Q9GZN8 174 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRJ-208ENST00000615445 VAPAQ9P0L0 249 aa19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms