RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 LRRTM2O43300 516 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SOD2P04179 222 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ACADMP11310 421 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GLULP15104 373 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PER3P56645 1201 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RGS1Q08116 209 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CNIH2Q6PI25 160 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CRTC1Q6UUV9 634 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GAREM2Q75VX8 874 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 KIF18BQ86Y91 864 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 VRK3Q8IV63 474 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 C9orf62Q8N4C0 152 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 LRRC17Q8N6Y2 441 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SYT14Q8NB59 555 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 INSL5Q9Y5Q6 135 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CHD7Q9P2D1 2997 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 COL4A6Q14031 1691 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 HYKKA2RU49 373 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 FAM227AF5H4B4 570 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 LHCGRP22888 699 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CCR7P32248 378 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RPA4Q13156 261 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 LRRC32Q14392 662 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 KLHL12Q53G59 568 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZNF783Q6ZMS7 281 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 NAGSQ8N159 534 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 NXPE1Q8N323 547 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 MED28Q9H204 178 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ARL15Q9NXU5 204 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CFAP97Q9P2B7 532 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 FAM8A1Q9UBU6 413 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PCDH7O60245 1069 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 APOL3O95236 402 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CKMP06732 381 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 HBQ1P09105 142 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 LAMP1P11279 417 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CHMP24386 653 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 MAPK1P28482 360 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SSTR2P30874 369 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CRYBA2P53672 197 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 NOXRED1Q6NXP6 359 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TMEM65Q6PI78 240 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ASB18Q6ZVZ8 466 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 FAM9CQ8IZT9 166 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TRPS1Q9UHF7 1281 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SNX11Q9Y5W9 270 aa12.85□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SH3D21A4FU49 640 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PITPNM1O00562 1244 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CASKO14936 926 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 HPGDSO60760 199 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PRAMEF10O60809 474 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GABRR2P28476 465 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SPAM1P38567 509 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SELENOWP63302 87 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RHAGQ02094 409 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 BTN1A1Q13410 526 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 STK11Q15831 433 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RETSATQ6NUM9 610 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CMTM8Q8IZV2 173 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 C11orf65Q8NCR3 313 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RIT1Q92963 219 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TESCQ96BS2 214 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 KCTD7Q96MP8 289 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 NELL2Q99435 816 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PADI2Q9Y2J8 665 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PROM1O43490 865 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GADD45GO95257 159 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PRPS1L1P21108 318 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 HOXD10P28358 340 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 RAB14P61106 215 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 VEZF1Q14119 521 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 ZMYND11Q15326 602 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 FCN2Q15485 313 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 IFI44LQ53G44 452 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 FRMPD2BQ6IN97 320 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TMEM145Q8NBT3 493 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PXYLP1Q8TE99 480 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 USP7Q93009 1102 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 MND1Q9BWT6 205 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 SH3BP4Q9P0V3 963 aa12.84□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TRIM77I1YAP6 450 aa12.83□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 PRAMEF4O60810 478 aa12.83□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 GASTP01350 101 aa12.83□□□□□ -0.35
NISCH-212ENST00000488380 TP53P04637 393 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms