RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470563.5

RBM39-227, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 3

Gene RBM39, Length 384 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-227	ENST00000470563	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NRAP	Q86VF7	1730 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PDLIM1	O00151	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ACOT8	O14734	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	EPHB6	O15197	1021 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	BUB1	O43683	1085 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PRKAB2	O43741	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NOL4	O94818	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	GLCE	O94923	617 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CCNB1	P14635	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	LBP	P18428	481 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	IL10	P22301	178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	DCT	P40126	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KCNJ1	P48048	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KLK7	P49862	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	AP1B1	Q10567	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TAF10	Q12962	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NPRL3	Q12980	569 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	BNIP1	Q12981	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62	2e-8	■□□□□ 8.7
RBM39-227	ENST00000470563	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	FAM228A	Q86W67	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	METTL13	Q8N6R0	699 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	BBOF1	Q8ND07	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	SENP1	Q9P0U3	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563	STRC	Q7RTU9	1775 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-227	ENST00000470563		A0A087X0T9	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	C17orf105	B2RV13	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PDXK	O00764	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	KCNAB3	O43448	404 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SCO2	O43819	266 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SLC28A2	O43868	658 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	KERA	O60938	352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	DCTN3	O75935	186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	KRT36	O76013	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ANP32D	O95626	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	FAM228B	P0C875	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PDHB	P11177	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ACADS	P16219	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	OR3A1	P47881	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	OR3A3	P47888	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NOV	P48745	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	FMO5	P49326	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NAPA	P54920	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	NCALD	P61601	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	DR1	Q01658	176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	DMPK	Q09013	629 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SGCB	Q16585	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-227	ENST00000470563	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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