RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 ATXN10Q9UBB4 475 aa4.6□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 CD84Q9UIB8 345 aa4.6□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa4.6□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.6□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 HPCAL4Q9UM19 191 aa4.6□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 PLCL2Q9UPR0 1127 aa4.6□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 SCINQ9Y6U3 715 aa4.6□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 KMOO15229 486 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 SLC25A17O43808 307 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 PROP1O75360 226 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 TNFSF13O75888 250 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 LY6HO94772 140 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 IGHDP01880 384 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 RPN1P04843 607 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 SFTPBP07988 381 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 ALOX5P09917 674 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 C8orf89P0DMQ9 161 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 ADRA2CP18825 462 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 AP3M2P53677 418 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 GAB1Q13480 694 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 SPOPLQ6IQ16 392 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 TTI2Q6NXR4 508 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 PRMT9Q6P2P2 845 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 SHC4Q6S5L8 630 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 LRRC31Q6UY01 552 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 GPBP1Q86WP2 473 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 SYCP3Q8IZU3 236 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 SLC4A11Q8NBS3 891 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 PSD4Q8NDX1 1056 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 OR4E2Q8NGC2 313 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 NANPQ8TBE9 248 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 FAM71BQ8TC56 605 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 C22orf15Q8WYQ4 148 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 RCHY1Q96PM5 261 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 SIK2Q9H0K1 926 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 KLK15Q9H2R5 256 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 CBLN4Q9NTU7 201 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 EURLQ9NYK6 297 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 HESX1Q9UBX0 185 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 TRIM10Q9UDY6 481 aa4.59□□□□□ -1.67
OPTN-209ENST00000469025 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 A0A0G2JMM0 328 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 A0A1W2PPB8 328 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 A0A1W2PRS3 328 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 KIR3DP1A8MWS1 328 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 MYO1FO00160 1098 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 BTN3A3O00478 584 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 FCHO1O14526 889 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 KDELR3O43731 214 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 ERLIN1O75477 346 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 GBAP04062 536 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CYC1P08574 325 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CSNK1DP48730 415 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 KRT81Q14533 505 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SYTL3Q4VX76 610 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 NCMAPQ5T1S8 102 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 PMF1Q6P1K2 205 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 VWA1Q6PCB0 445 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SPESP1Q6UW49 350 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 RFLNAQ6ZTI6 216 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 RASGEF1CQ8N431 466 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 KBTBD8Q8NFY9 601 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 NEIL3Q8TAT5 605 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SLC35F5Q8WV83 523 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 TMX3Q96JJ7 454 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 C18orf15Q96N68 181 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 GPA33Q99795 319 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 BLZF1Q9H2G9 400 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 FAM204AQ9H8W3 233 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 DNAJC11Q9NVH1 559 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SH2B3Q9UQQ2 575 aa4.58□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 DNAH2Q9P225 4427 aa4.57□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 FEZF1A0PJY2 475 aa4.57□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 C2orf74A8MZ97 194 aa4.57□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 SGTAO43765 313 aa4.57□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 MSMBP08118 114 aa4.57□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 VCLP18206 1134 aa4.57□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 PTNP21246 168 aa4.57□□□□□ -1.68
OPTN-209ENST00000469025 TBXA2RP21731 343 aa4.57□□□□□ -1.68
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