RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF540Q8NDQ6 660 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MS4A6EQ96DS6 147 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THAP11Q96EK4 314 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIPA1Q96FS4 1042 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSF3RQ99062 836 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLGRKTQ9HBL7 147 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EHD3Q9NZN3 535 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCML1Q9UN30 329 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POFUT2Q9Y2G5 429 aa17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC88CQ9P219 2028 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A8MVJ9 347 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERI3O43414 337 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH3BP5O60239 455 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM20BO75063 409 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RHCEP18577 417 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AHRP35869 848 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMGA2P52926 109 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNC4Q03721 635 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAPK11Q15759 364 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASB12Q8WXK4 309 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMDHD1Q96NU7 426 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SARGQ9BW04 601 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLIPR2Q9H4G4 154 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERHL2Q9H4I8 314 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D29Q9UFV1 150 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSME2Q9UL46 239 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa17.74■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFS2O75306 463 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FUT4P22083 530 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GGT2P36268 569 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSSP48637 474 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1024LP59773 190 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC32Q14392 662 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GANABQ14697 944 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC9A5Q14940 896 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR9Q2Q8NGE9 314 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM81AQ8TBF8 368 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAIM2Q9BWQ8 316 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF6Q9Y252 685 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0J9YVX5 310 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WASHC1A8K0Z3 465 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAN2B1O00754 1011 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDH17O14917 1159 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM1AO60341 852 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MFN2O95140 757 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GADD45GO95257 159 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EML2O95834 649 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABHD17CQ6PCB6 329 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WASH2PQ6VEQ5 465 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP30Q70CQ3 517 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CROCCP3Q8IVE0 287 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR8K5Q8NH50 307 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR1E3Q8WZA6 343 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RORBQ92753 470 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSD2Q9BQI7 771 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYNPO2LQ9H987 977 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD93Q9NPY3 652 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRDM7Q9NQW5 492 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENPP5Q9UJA9 477 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa17.73■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGS10O43665 173 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VIPP01282 170 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MT-ND2P03891 347 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD72P21854 359 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CMPK1P30085 196 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAP2K4P45985 399 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MASP1P48740 699 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENTPD1P49961 510 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLAMF1Q13291 335 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCEA2Q15560 299 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENPP7Q6UWV6 458 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D19Q8N5T2 526 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACOT4Q8N9L9 421 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2L5Q8NG80 312 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR32P1Q8NGA4 272 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCND3Q9UK17 655 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CA5BQ9Y2D0 317 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL20Q9Y2M5 609 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASB4Q9Y574 426 aa17.72■□□□□ 0.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLOD5A6NK44 160 aa17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms