RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CCDC138Q96M89 665 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 KCNA7Q96RP8 456 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ACTR8Q9H981 624 aa6.26□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 ZNF225Q9UK10 706 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 BTRCQ9Y297 605 aa6.26□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 SVILO95425 2214 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.25□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 KIAA1024LP59773 190 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ACTR3P61158 418 aa6.25□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 E2F2Q14209 437 aa6.25□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 PNCKQ6P2M8 343 aa6.25□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 SAP25Q8TEE9 199 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 NAT14Q8WUY8 206 aa6.25□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 SOX7Q9BT81 388 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TEX101Q9BY14 249 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.25□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.24□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.24□□□□□ -1.41
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CCL20-202ENST00000409189 IGLON5A6NGN9 336 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 A8MUI8 341 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 NR5A2O00482 541 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TOR1BO14657 336 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 MRASO14807 208 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ANGPT2O15123 496 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 KMOO15229 486 aa6.24□□□□□ -1.41
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