RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 VTCN1Q7Z7D3 282 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLM1Q8NBJ4 401 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 OR8J1Q8NGP2 316 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTR6Q9GZN1 396 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 Q9Y3F1 56 aa23.19■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 CHRFAM7AQ494W8 412 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SYNPOQ8N3V7 929 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC6A7Q99884 636 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 PADI2Q9Y2J8 665 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SFTPBP07988 381 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 GNSP15586 552 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SPHARQ15513 63 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPA12AO43301 675 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 RHCEP18577 417 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 CLCN2P51788 898 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 UAP1L1Q3KQV9 507 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 OR56A3Q8NH54 315 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 PEX13Q92968 403 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCC6O95255 1503 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 AGAP5A6NIR3 686 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 GGT1P19440 569 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 BEND4Q6ZU67 534 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 S100PBPQ96BU1 408 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SPEF2Q9C093 1822 aa23.18■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 F5H0A9 414 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 Q6ZVL8 140 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 AVL9Q8NBF6 648 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 NUP43Q8NFH3 380 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4C15Q8NGM1 316 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 DENND1AQ8TEH3 1009 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 INSL5Q9Y5Q6 135 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 RFPL2O75678 378 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 PGGT1BP53609 377 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 NKAPLQ5M9Q1 402 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 STEAP4Q687X5 459 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC32Q9BV29 185 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TOXO94900 526 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBG1P23258 451 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 UQCRC1P31930 480 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 CES4AQ5XG92 561 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 KLBQ86Z14 1044 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 DHDHQ9UQ10 334 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 PMS2P3Q13401 168 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 PDSS1Q5T2R2 415 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM184CQ9NVA4 438 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SOBPA7XYQ1 873 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 C11orf98E9PRG8 122 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPAN6O43657 245 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ETV3P41162 512 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TLE2Q04725 743 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM53Q6P2H8 277 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ENY2Q9NPA8 101 aa23.17■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TNFRSF10BO14763 440 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 JUPP14923 745 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 GABRA3P34903 492 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM156Q8N614 296 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF283Q8N7M2 679 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 C7orf34Q96L11 122 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SNNO75324 88 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNA2P01563 188 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 HLA-EP13747 358 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 HSD3B1P14060 373 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 FDXRP22570 491 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 HSD3B2P26439 372 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SNTA1Q13424 505 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 HMGN2P46Q86SG4 172 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 NOX1Q9Y5S8 564 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SMCO3A2RU48 225 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 CTBP2P56545 445 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 GRHL2Q6ISB3 625 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 GPAT4Q86UL3 456 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 UBQLNLQ8IYU4 475 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNOP22674 350 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 DCKP27707 260 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 LCN8Q6JVE9 175 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR83Q9NYM4 423 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 DKKL1Q9UK85 242 aa23.16■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKYO43930 277 aa23.15■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 FRKP42685 505 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 GPM6BQ13491 265 aa23.15■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4D1Q15615 310 aa23.15■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ELMOD2Q8IZ81 293 aa23.15■■□□□ 1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ELP5Q8TE02 316 aa23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms