RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM80Q96HE8 168 aa16.47■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM19Q96HH6 336 aa16.47■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 PHOX2BQ99453 314 aa16.47■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.47■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 SLC46A2Q9BY10 475 aa16.47■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 NPAP1Q9NZP6 1156 aa16.47■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 HEPACAM2A8MVW5 462 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 CDRT1O95170 752 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 KRT75O95678 551 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 TIMP2P16035 220 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 TNNI3P19429 210 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 SSTR4P31391 388 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 RORCP51449 518 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 SLC7A9P82251 487 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 GRIN2CQ14957 1233 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF284Q2VY69 593 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 FLYWCH1Q4VC44 716 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 RAB43Q86YS6 212 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 CFAP206Q8IYR0 622 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 FOPNLQ96NB1 174 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 IL17FQ96PD4 163 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 ACAT2Q9BWD1 397 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 ABCB9Q9NP78 766 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 STUB1Q9UNE7 303 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 MEIOCA2RUB1 952 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF197O14709 1029 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 B4GALT2O60909 372 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 UGT2B17O75795 530 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 XKP51811 444 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 TLE2Q04725 743 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 VN1R5Q7Z5H4 357 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 COMTD1Q86VU5 262 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 KRT73Q86Y46 540 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 TMC8Q8IU68 726 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 PHC2Q8IXK0 858 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 REPS1Q96D71 796 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 NDUFB11Q9NX14 153 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 PLAGL1Q9UM63 463 aa16.46■□□□□ 0.23
PDE4A-201ENST00000293683 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 RFXAPO00287 272 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 ADAP00813 363 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 TM4SF4P48230 202 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 DCDC1P59894 354 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 HYAL2Q12891 473 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 MIXL1Q9H2W2 232 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 TMCC3Q9ULS5 477 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 CARD8Q9Y2G2 431 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 DYRK1BQ9Y463 629 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 HYKKA2RU49 373 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 ARRDC5A6NEK1 342 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 C5orf58C9J3I9 102 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 PRKYO43930 277 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 CSF2P04141 144 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 TAP2Q03519 686 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 C22orf42Q6IC83 251 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 FAM131AQ6UXB0 335 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 ADIPOR2Q86V24 386 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 NANOGP1Q8N7R0 232 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 SLC7A13Q8TCU3 470 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 AP2M1Q96CW1 435 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 NLNQ9BYT8 704 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 TVP23BQ9NYZ1 205 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 SPG21Q9NZD8 308 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 SEC14L4Q9UDX3 406 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 CDH23Q9H251 3354 aa16.45■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 USP34Q70CQ2 3546 aa16.44■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 FAM172BPA6NC97 362 aa16.44■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 K7ESM1 405 aa16.44■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 MSL3P1P0C860 447 aa16.44■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 ALDH9A1P49189 494 aa16.44■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 HOXC5Q00444 222 aa16.44■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 HSPB3Q12988 150 aa16.44■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 31.6
PDE4A-201ENST00000293683 ILKQ13418 452 aa16.44■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 DCST1Q5T197 706 aa16.44■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.44■□□□□ 0.22
PDE4A-201ENST00000293683 CASP12Q6UXS9 341 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.1 ms