RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 LIMS1P48059 325 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPDYE7PQ495Y7 208 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SDE2Q6IQ49 451 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ABCG4Q9H172 646 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A1W2PQ72 361 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 HPGDSO60760 199 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFNW1P05000 195 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 HOXD10P28358 340 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 RBBP4Q09028 425 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 ASAH1Q13510 395 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 COMMD6Q7Z4G1 85 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 RDH10Q8IZV5 341 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TM9SF4Q92544 642 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC25A46Q96AG3 418 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 DEFB118Q96PH6 123 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEC14L4Q9UDX3 406 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.824e-7■■□□□ 13.3
CSNK1G2-201ENST00000255641 EVI2BP34910 448 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 IL12RB1P42701 662 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRRC32Q14392 662 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR19Q15760 415 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM26DQ5JW98 314 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TIGD4Q8IY51 512 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.826e-7■■■■□ 23.3
CSNK1G2-201ENST00000255641 GFYI3L273 518 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLK1P06870 262 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLET1Q6UQ28 207 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 UPRTQ96BW1 309 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLD4Q96BZ4 506 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRR14Q9BWN1 585 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 CWH43Q9H720 699 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 NDUFB11Q9NX14 153 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMCC3Q9ULS5 477 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRMT3O60678 531 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 DPM1O60762 260 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 CBSLP0DN79 551 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFNA8P32881 189 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 CBSP35520 551 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 HNMTP50135 292 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 XKP51811 444 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 SZRD1Q7Z422 152 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR3A3P47888 321 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTSCP53634 463 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANXA8L1Q5VT79 327 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 CASP12Q6UXS9 341 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 COMTD1Q86VU5 262 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 NANOGP1Q8N7R0 232 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR32P1Q8NGA4 272 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR52N2Q8NGI0 321 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 VOPP1Q96AW1 172 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 KATNB1Q9BVA0 655 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM25AB3EWG3 89 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM25CB3EWG5 89 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM25GB3EWG6 89 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 VEGFBP49765 207 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 RHAGQ02094 409 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 LMAN2Q12907 356 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 CNIH2Q6PI25 160 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHST14Q8NCH0 376 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHTF18Q8WVB6 975 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPCDCQ96CD2 204 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 THSD1Q9NS62 852 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC23A1Q9UHI7 598 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 RTCAO00442 366 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSPAN6O43657 245 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 SH3BP5O60239 455 aa20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPS5P46782 204 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CSNK1G2-201ENST00000255641 AVPR1BP47901 424 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms